More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0580 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  100 
 
 		 451 aa  917    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3318  type I secretion outer membrane protein, TolC family  51.91 
 
 		 470 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0993  type I secretion outer membrane protein, TolC family  51.91 
 
 		 475 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4381  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.95 
 
 		 477 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108825  normal  0.496475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2887  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29 
 
 		 469 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.415153  normal  0.13847 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0805  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.29 
 
 		 478 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2905  type I secretion outer membrane protein TolC family  29 
 
 		 469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.488456 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2906  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29 
 
 		 469 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0829  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.05 
 
 		 478 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.461433 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.06 
 
 		 636 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3018  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.75 
 
 		 469 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.384034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0844  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.5 
 
 		 478 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3120  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.62 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.893346  normal  0.154573 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3710  outer membrane efflux protein  28.64 
 
 		 564 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4602  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.2 
 
 		 444 aa  124  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.51 
 
 		 456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.48 
 
 		 524 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.47 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  25.39 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05071  putative outer membrane efflux transmembrane protein  27.64 
 
 		 483 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.485043  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  24.48 
 
 		 425 aa  114  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2168  outer membrane efflux protein  28.4 
 
 		 459 aa  114  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.31 
 
 		 494 aa  113  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  24.06 
 
 		 436 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.75 
 
 		 456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  24.52 
 
 		 445 aa  111  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  24.36 
 
 		 423 aa  110  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.32 
 
 		 450 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.97 
 
 		 609 aa  107  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.73 
 
 		 478 aa  106  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0634  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.61 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000541353  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  23.82 
 
 		 436 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  24.94 
 
 		 472 aa  104  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.66 
 
 		 450 aa  103  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.62 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.08 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.75 
 
 		 480 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  25.28 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.03 
 
 		 607 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.77 
 
 		 658 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.12 
 
 		 431 aa  99.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.28 
 
 		 484 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0633  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.31 
 
 		 484 aa  98.2  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458641  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2659  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.73 
 
 		 451 aa  97.4  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.54 
 
 		 538 aa  96.7  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0134  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.35 
 
 		 450 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25 
 
 		 450 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.66 
 
 		 452 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0054  outer membrane efflux protein  25.33 
 
 		 520 aa  95.5  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.906913  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1880  outer membrane protein  26.73 
 
 		 492 aa  94.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.55 
 
 		 501 aa  94.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.78 
 
 		 519 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.74 
 
 		 445 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.2 
 
 		 522 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  26.26 
 
 		 456 aa  93.2  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.16 
 
 		 452 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.16 
 
 		 452 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.72 
 
 		 451 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  22.79 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.15 
 
 		 471 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.32 
 
 		 452 aa  92.4  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1664  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.25 
 
 		 466 aa  90.9  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.623373  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0010  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.74 
 
 		 443 aa  90.9  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444301  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.52 
 
 		 464 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.77 
 
 		 463 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.51 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3411  hypothetical protein  21.81 
 
 		 425 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.94 
 
 		 471 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  23.84 
 
 		 490 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.23 
 
 		 452 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  22.82 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  23.98 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.47 
 
 		 472 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.24 
 
 		 471 aa  87.8  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.94 
 
 		 488 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.76 
 
 		 468 aa  88.2  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.94 
 
 		 472 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.94 
 
 		 497 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  25.7 
 
 		 438 aa  87.4  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40250  putative outer membrane protein precursor  21.18 
 
 		 425 aa  87  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.06 
 
 		 475 aa  86.7  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.37 
 
 		 487 aa  86.7  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.34 
 
 		 472 aa  86.3  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.03 
 
 		 472 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.83 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.83 
 
 		 472 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.96 
 
 		 497 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.88 
 
 		 488 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.47 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.23 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.83 
 
 		 633 aa  85.5  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0784  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.21 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.649029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  26.99 
 
 		 738 aa  85.9  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.82 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.48 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0375  Outer membrane protein-like  25.07 
 
 		 667 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.4 
 
 		 470 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.13 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.13 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.25 
 
 		 485 aa  83.2  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>