More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003406 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  100 
 
 
423 aa  863    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  84.93 
 
 
436 aa  738    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  85.24 
 
 
436 aa  744    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  72.34 
 
 
445 aa  640    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  92.2 
 
 
425 aa  805    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  65.95 
 
 
440 aa  578  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  64.12 
 
 
437 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  43.71 
 
 
469 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.79 
 
 
475 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  41.63 
 
 
469 aa  364  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.11 
 
 
470 aa  361  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  41.69 
 
 
470 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  41.93 
 
 
473 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  41.93 
 
 
473 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.34 
 
 
471 aa  352  8e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  41.55 
 
 
468 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  41.89 
 
 
471 aa  351  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.57 
 
 
471 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.57 
 
 
471 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  41.93 
 
 
472 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  41.93 
 
 
472 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  41.89 
 
 
471 aa  349  5e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  40.59 
 
 
472 aa  347  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.37 
 
 
501 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  36.54 
 
 
450 aa  293  4e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  36.54 
 
 
450 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.65 
 
 
431 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1293  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  38.24 
 
 
430 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.01 
 
 
445 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0134  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.96 
 
 
450 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675891  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.15 
 
 
442 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0204  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.46 
 
 
441 aa  251  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.85 
 
 
451 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.36 
 
 
457 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.36 
 
 
456 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.97 
 
 
452 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.67 
 
 
457 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.73 
 
 
452 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1664  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.22 
 
 
466 aa  229  8e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.623373  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.49 
 
 
452 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.49 
 
 
471 aa  226  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.02 
 
 
452 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.73 
 
 
472 aa  225  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0784  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.16 
 
 
491 aa  222  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.649029  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0633  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.27 
 
 
484 aa  211  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458641  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.48 
 
 
484 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  29.81 
 
 
574 aa  199  7e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  29.61 
 
 
574 aa  197  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.88 
 
 
609 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.62 
 
 
633 aa  190  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.22 
 
 
450 aa  190  5e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0790  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.58 
 
 
440 aa  189  7e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000109355  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1880  outer membrane protein  29.68 
 
 
492 aa  187  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.93 
 
 
636 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.69 
 
 
607 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2659  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.33 
 
 
451 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.14 
 
 
444 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.57 
 
 
658 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.36 
 
 
450 aa  173  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.47 
 
 
475 aa  169  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.27 
 
 
472 aa  167  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0888  ComEC/Rec2 family protein  29.26 
 
 
559 aa  162  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289662  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.63 
 
 
519 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0010  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.38 
 
 
443 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.67 
 
 
524 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0160  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.64 
 
 
566 aa  159  7e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.213741  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1875  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.81 
 
 
476 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1978  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.33 
 
 
456 aa  156  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143142  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.31 
 
 
456 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  27.02 
 
 
472 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.62 
 
 
488 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.62 
 
 
497 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0634  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.24 
 
 
467 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000541353  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.32 
 
 
464 aa  119  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.7 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.3 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.7 
 
 
489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.84 
 
 
464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.43 
 
 
488 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.46 
 
 
518 aa  116  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.67 
 
 
460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40250  putative outer membrane protein precursor  23.59 
 
 
425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311034  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3411  hypothetical protein  23.83 
 
 
425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.65 
 
 
455 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  24.36 
 
 
451 aa  110  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  23.66 
 
 
461 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.44 
 
 
463 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.27 
 
 
553 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.79 
 
 
463 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  22.82 
 
 
490 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.99 
 
 
472 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.17 
 
 
487 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  24.02 
 
 
438 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.17 
 
 
478 aa  100  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.17 
 
 
480 aa  100  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.47 
 
 
461 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  23.88 
 
 
456 aa  98.2  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  23.88 
 
 
452 aa  97.8  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.77 
 
 
483 aa  97.1  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.38 
 
 
472 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>