68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0278 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0278  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 421 aa  839    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73949  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4326  outer membrane efflux protein  36.13 
 
 		 467 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.655626  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2845  outer membrane efflux protein  32.83 
 
 		 447 aa  204  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.627274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0785  outer membrane efflux protein  32.73 
 
 		 433 aa  193  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0759  outer membrane efflux protein  25.2 
 
 		 534 aa  93.6  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000466855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2274  outer membrane efflux protein  26 
 
 		 459 aa  89.7  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1600  OMF family outer membrane efflux protein  22.14 
 
 		 514 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00101188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3411  hypothetical protein  25.8 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40250  putative outer membrane protein precursor  25.84 
 
 		 425 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2887  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.88 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.415153  normal  0.13847 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2906  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.63 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2905  type I secretion outer membrane protein TolC family  24.88 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.488456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3018  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.63 
 
 		 469 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.384034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3120  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.57 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.893346  normal  0.154573 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0634  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.85 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000541353  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.57 
 
 		 609 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4602  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.09 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3318  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.94 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.45 
 
 		 450 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  20.87 
 
 		 436 aa  57  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0805  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.94 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0054  outer membrane efflux protein  23.48 
 
 		 520 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.906913  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0829  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.94 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.461433 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.29 
 
 		 464 aa  53.5  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0844  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.19 
 
 		 478 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.25 
 
 		 562 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.33 
 
 		 497 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1978  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.87 
 
 		 456 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.02 
 
 		 444 aa  51.6  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.11 
 
 		 519 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0993  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.59 
 
 		 475 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  23.05 
 
 		 436 aa  50.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.21 
 
 		 524 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4381  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.94 
 
 		 477 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108825  normal  0.496475 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  20.75 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.06 
 
 		 472 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.27 
 
 		 538 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0010  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.26 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  24.27 
 
 		 565 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.29 
 
 		 633 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  29.69 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.79 
 
 		 452 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2659  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.43 
 
 		 451 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25 
 
 		 472 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  24.01 
 
 		 422 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.52 
 
 		 450 aa  46.6  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1740  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.74 
 
 		 517 aa  46.6  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1020  putative outer membrane protein TolC  21.12 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.808388  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.79 
 
 		 501 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0823  Outer membrane efflux protein  20.19 
 
 		 432 aa  45.8  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0383439  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2896  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.74 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.66 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1145  anibiotic ABC transporter efflux pump  24.8 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  24.43 
 
 		 458 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  23.34 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2168  outer membrane efflux protein  30.73 
 
 		 459 aa  44.3  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 423 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.81 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.38 
 
 		 471 aa  43.9  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  22.18 
 
 		 454 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  23.05 
 
 		 442 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2159  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.04 
 
 		 529 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  26.65 
 
 		 423 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.21 
 
 		 463 aa  43.9  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.16 
 
 		 480 aa  43.5  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  35.29 
 
 		 425 aa  43.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.32 
 
 		 504 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>