83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2274 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2274  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 459 aa  941    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0759  outer membrane efflux protein  30.12 
 
 		 534 aa  152  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000466855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1600  OMF family outer membrane efflux protein  28.67 
 
 		 514 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00101188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.04 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0278  outer membrane efflux protein  25.75 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73949  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.02 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4326  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 		 467 aa  69.3  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.655626  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0634  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.44 
 
 		 467 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000541353  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0784  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.26 
 
 		 491 aa  67.4  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.649029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0785  outer membrane efflux protein  24.03 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2990  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000136016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3710  outer membrane efflux protein  23.31 
 
 		 564 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1664  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.55 
 
 		 466 aa  62  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.623373  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3411  hypothetical protein  21.98 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.13 
 
 		 456 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.8 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  20.96 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.13 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  19.32 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  19.95 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2845  outer membrane efflux protein  21.33 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.627274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  18.11 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.47 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40250  putative outer membrane protein precursor  21.43 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.97 
 
 		 471 aa  57  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.37 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.37 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  19.85 
 
 		 440 aa  55.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  23.08 
 
 		 469 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  20.41 
 
 		 423 aa  54.7  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1750  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.37 
 
 		 498 aa  54.3  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0410029 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0633  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.79 
 
 		 484 aa  54.3  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458641  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  24.08 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  23.13 
 
 		 471 aa  50.1  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  17.95 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.08 
 
 		 498 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0987986 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1978  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.86 
 
 		 456 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1387  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.75 
 
 		 498 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.97 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  21.84 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.24 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  22.5 
 
 		 574 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.2 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0204  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.16 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2077  outer membrane efflux protein  27.22 
 
 		 580 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.668276 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.17 
 
 		 527 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1481  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.23 
 
 		 498 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1724  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.06 
 
 		 515 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.23 
 
 		 498 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.42 
 
 		 464 aa  47.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  21.79 
 
 		 574 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.05 
 
 		 483 aa  46.6  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4646  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.08 
 
 		 498 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590697  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.92 
 
 		 470 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.14 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.45 
 
 		 471 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.45 
 
 		 471 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  21.62 
 
 		 421 aa  45.8  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.11 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  21.58 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0170  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.58 
 
 		 498 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0737823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1056  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.58 
 
 		 498 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0996  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.58 
 
 		 498 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1745  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  23.58 
 
 		 498 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134149  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.58 
 
 		 514 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.58 
 
 		 514 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  21.36 
 
 		 471 aa  44.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1768  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  23.58 
 
 		 493 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.66 
 
 		 489 aa  44.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  21.35 
 
 		 451 aa  44.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.17 
 
 		 471 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2659  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.06 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1841  outer membrane efflux protein  22.85 
 
 		 471 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.18 
 
 		 484 aa  43.9  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.78 
 
 		 472 aa  43.5  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1738  putative outer membrane protein TolC  23.7 
 
 		 521 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.23 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.95 
 
 		 450 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4184  outer membrane efflux protein  22.92 
 
 		 471 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4182  outer membrane efflux protein  22.92 
 
 		 471 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  27.31 
 
 		 477 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1822  putative outer membrane protein TolC  23.7 
 
 		 476 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  23.12 
 
 		 420 aa  43.1  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>