151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2077 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2077  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 580 aa  1152    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.668276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4455  outer membrane efflux protein  42.09 
 
 		 518 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790161  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.1 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.63 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  22.86 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.77 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.55 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  23.25 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.17 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.06 
 
 		 489 aa  69.7  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  24.72 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0204  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.3 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0160  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.5 
 
 		 566 aa  68.2  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.213741  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.64 
 
 		 463 aa  67  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.36 
 
 		 522 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0888  ComEC/Rec2 family protein  22.95 
 
 		 559 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289662  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  21.61 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.3 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.71 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4381  TolC family type I secretion outer membrane protein  24 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108825  normal  0.496475 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0759  outer membrane efflux protein  23.41 
 
 		 534 aa  65.5  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000466855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.82 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  21.16 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.87 
 
 		 609 aa  64.7  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.82 
 
 		 497 aa  64.7  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2168  outer membrane efflux protein  28.74 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280294 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.27 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0634  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.96 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000541353  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  22 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.02 
 
 		 469 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  26.42 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.14 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.33 
 
 		 607 aa  60.5  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.47 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.02 
 
 		 442 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  23.31 
 
 		 490 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.9 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  21.7 
 
 		 436 aa  59.7  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.85 
 
 		 497 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.49 
 
 		 487 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.05 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.29 
 
 		 636 aa  58.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.85 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.61 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.1 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.96 
 
 		 491 aa  58.9  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0375  Outer membrane protein-like  25.23 
 
 		 667 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22 
 
 		 658 aa  58.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.1 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0829  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.73 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.461433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0805  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.2 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.16 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.02 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.68 
 
 		 524 aa  57.4  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  23.09 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.95 
 
 		 452 aa  57  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  22.73 
 
 		 452 aa  57  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.02 
 
 		 450 aa  57  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.94 
 
 		 453 aa  57  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.16 
 
 		 478 aa  56.6  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.48 
 
 		 477 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3147  outer membrane efflux protein  24.11 
 
 		 495 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.39 
 
 		 452 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.87 
 
 		 464 aa  57  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.15 
 
 		 484 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0844  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.73 
 
 		 478 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.53 
 
 		 451 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.47 
 
 		 455 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  22.49 
 
 		 456 aa  55.5  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.57 
 
 		 461 aa  55.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2990  outer membrane efflux protein  27.46 
 
 		 434 aa  55.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000136016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.48 
 
 		 452 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.78 
 
 		 477 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.37 
 
 		 442 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.4 
 
 		 538 aa  55.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.53 
 
 		 519 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.4 
 
 		 456 aa  55.1  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.73 
 
 		 446 aa  54.7  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.78 
 
 		 477 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  21.54 
 
 		 418 aa  54.3  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  27.33 
 
 		 437 aa  53.9  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  22.06 
 
 		 437 aa  53.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  24.7 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.43 
 
 		 452 aa  53.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.29 
 
 		 463 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0251  Outer membrane efflux protein  24.32 
 
 		 466 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608595  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  20.19 
 
 		 441 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.01 
 
 		 442 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.37 
 
 		 452 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3077  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.19 
 
 		 491 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.762548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2494  outer membrane efflux protein  27.03 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.25 
 
 		 478 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.51 
 
 		 494 aa  52.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  29.94 
 
 		 456 aa  52  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  23.34 
 
 		 493 aa  51.6  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.99 
 
 		 472 aa  51.6  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.1 
 
 		 450 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.24 
 
 		 450 aa  51.2  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1600  OMF family outer membrane efflux protein  23.4 
 
 		 514 aa  51.2  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00101188  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>