99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3147 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_3147  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 495 aa  993    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1762  Outer membrane protein-like protein  29.06 
 
 		 481 aa  133  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00778086 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  24.93 
 
 		 574 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  25.2 
 
 		 574 aa  99.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.35 
 
 		 501 aa  97.1  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.18 
 
 		 472 aa  94  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.97 
 
 		 445 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.39 
 
 		 457 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.89 
 
 		 452 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0204  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.82 
 
 		 441 aa  88.2  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.64 
 
 		 452 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  22.55 
 
 		 437 aa  84.3  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.87 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.74 
 
 		 609 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.95 
 
 		 484 aa  82.4  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.25 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.37 
 
 		 450 aa  82  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.88 
 
 		 452 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.23 
 
 		 456 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.36 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  23.6 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.26 
 
 		 475 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.82 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.17 
 
 		 475 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.08 
 
 		 473 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.08 
 
 		 473 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3710  outer membrane efflux protein  24.5 
 
 		 564 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0134  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.92 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.36 
 
 		 636 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1880  outer membrane protein  24.81 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  22.51 
 
 		 436 aa  72  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.06 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.06 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1664  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.44 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.623373  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.84 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.84 
 
 		 472 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  23.85 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.55 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.26 
 
 		 470 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  22.43 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2299  outer membrane efflux protein  26.95 
 
 		 514 aa  68.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  22.6 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.81 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.59 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  23.52 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.25 
 
 		 633 aa  67.8  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.91 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3318  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.75 
 
 		 470 aa  67  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.94 
 
 		 452 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.59 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  22.35 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  23.44 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1875  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.48 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3411  hypothetical protein  24.39 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40250  putative outer membrane protein precursor  24.39 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2659  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.04 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0633  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.31 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458641  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.72 
 
 		 607 aa  63.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.03 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.36 
 
 		 442 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0010  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.11 
 
 		 443 aa  63.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444301  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0634  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.48 
 
 		 467 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000541353  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2168  outer membrane efflux protein  26.34 
 
 		 459 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280294 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.72 
 
 		 658 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.31 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  23.38 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0993  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.56 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1978  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.86 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2906  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.24 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3018  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.6 
 
 		 469 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.384034 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.83 
 
 		 472 aa  57  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0054  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 520 aa  56.6  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.906913  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2905  type I secretion outer membrane protein TolC family  22.98 
 
 		 469 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.488456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2887  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.26 
 
 		 469 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.415153  normal  0.13847 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.11 
 
 		 451 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4602  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.8 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0784  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.18 
 
 		 491 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.649029  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05071  putative outer membrane efflux transmembrane protein  24.26 
 
 		 483 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.485043  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.26 
 
 		 524 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.39 
 
 		 519 aa  53.9  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3120  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.17 
 
 		 467 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.893346  normal  0.154573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0805  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.73 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0829  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.44 
 
 		 478 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.461433 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.94 
 
 		 472 aa  50.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0844  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.89 
 
 		 478 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2077  outer membrane efflux protein  24.37 
 
 		 580 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.668276 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  19.61 
 
 		 440 aa  48.5  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4381  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.63 
 
 		 477 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108825  normal  0.496475 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  20.48 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0375  Outer membrane protein-like  25.81 
 
 		 667 aa  47.8  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0620  outer membrane efflux protein  23.55 
 
 		 435 aa  47.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000193694  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2435  outer membrane efflux protein  21.86 
 
 		 642 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0790  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.1 
 
 		 440 aa  45.8  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000109355  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  24.43 
 
 		 451 aa  45.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.27 
 
 		 462 aa  45.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.52 
 
 		 489 aa  44.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0888  ComEC/Rec2 family protein  25.56 
 
 		 559 aa  43.5  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289662  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 738 aa  43.5  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  24.4 
 
 		 452 aa  43.1  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>