93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2494 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2494  outer membrane efflux protein  100 
 
 
445 aa  878    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  26.28 
 
 
438 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.94 
 
 
494 aa  65.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1170  putative outer membrane protein TolC  25.34 
 
 
419 aa  64.3  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.109696  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.48 
 
 
494 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3318  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.87 
 
 
470 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.29 
 
 
445 aa  59.7  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  26.9 
 
 
470 aa  56.6  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.92 
 
 
489 aa  55.8  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2682  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.54 
 
 
451 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.829421  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  25.71 
 
 
456 aa  54.3  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1361  Outer membrane efflux protein  21.74 
 
 
416 aa  53.9  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.824117  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.62 
 
 
473 aa  53.1  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000188172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2077  outer membrane efflux protein  27.03 
 
 
580 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.668276 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0993  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.33 
 
 
475 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  25.32 
 
 
452 aa  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.39 
 
 
444 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.39 
 
 
444 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  25.22 
 
 
456 aa  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  21.71 
 
 
489 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  21.71 
 
 
489 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  21.71 
 
 
489 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  21.13 
 
 
419 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  21.71 
 
 
489 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  21.71 
 
 
489 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  24.21 
 
 
435 aa  51.2  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.75 
 
 
455 aa  51.2  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.47 
 
 
522 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.32 
 
 
463 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  19.91 
 
 
444 aa  50.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.25 
 
 
452 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.8 
 
 
446 aa  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1131  outer membrane efflux protein  20.26 
 
 
364 aa  50.1  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.14 
 
 
487 aa  50.1  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  18.85 
 
 
408 aa  50.1  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  21.96 
 
 
463 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.05 
 
 
450 aa  49.7  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 
473 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 
473 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  28.07 
 
 
469 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  26.94 
 
 
490 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.03 
 
 
441 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  27.6 
 
 
437 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.92 
 
 
442 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  22.89 
 
 
451 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.21 
 
 
452 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.29 
 
 
463 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.32 
 
 
442 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  25.75 
 
 
438 aa  47.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3159  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.97 
 
 
449 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.334096  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25 
 
 
464 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00407  putative outer membrane cation efflux system protein  27.82 
 
 
451 aa  47.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00236087  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0160  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  19.81 
 
 
566 aa  47.4  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.213741  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.22 
 
 
431 aa  46.6  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3328  ABC transporter, permease protein  24.76 
 
 
456 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0814  outer membrane efflux protein, putative  23.2 
 
 
452 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.64 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  26.34 
 
 
442 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.31 
 
 
497 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  24.22 
 
 
481 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  23.78 
 
 
444 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.93 
 
 
442 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.1 
 
 
480 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  21.57 
 
 
443 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3560  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.57 
 
 
493 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  26.43 
 
 
495 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  23.35 
 
 
436 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  26.43 
 
 
493 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  26.43 
 
 
493 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3473  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.49 
 
 
525 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0809824  normal  0.12883 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  18.73 
 
 
471 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.24 
 
 
480 aa  45.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.43 
 
 
493 aa  45.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  26.43 
 
 
493 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  26.43 
 
 
493 aa  45.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  26.43 
 
 
493 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.54 
 
 
538 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.49 
 
 
525 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  26.43 
 
 
495 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  26.43 
 
 
495 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.71 
 
 
497 aa  44.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0718  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.63 
 
 
442 aa  44.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0620  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 
435 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000193694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.31 
 
 
518 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.62 
 
 
456 aa  44.3  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0785  Outer membrane efflux protein  22.43 
 
 
453 aa  44.3  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  22.73 
 
 
500 aa  43.9  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  23.5 
 
 
496 aa  43.9  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  22.22 
 
 
491 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.73 
 
 
478 aa  43.9  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1557  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.64 
 
 
455 aa  43.5  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  26.32 
 
 
463 aa  43.5  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  25.73 
 
 
463 aa  43.1  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>