More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0833 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 496 aa  992    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  64.63 
 
 		 467 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  56.17 
 
 		 462 aa  499  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  56.49 
 
 		 463 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  55.45 
 
 		 483 aa  485  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  55.46 
 
 		 463 aa  484  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  50.79 
 
 		 470 aa  433  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  31.84 
 
 		 535 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  28.04 
 
 		 451 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  26.83 
 
 		 448 aa  162  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2515  outer membrane protein  26.42 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 		 442 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  28.6 
 
 		 1496 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 451 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  26.94 
 
 		 419 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  25.46 
 
 		 449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  24.25 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  25.76 
 
 		 455 aa  136  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 		 462 aa  134  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 		 443 aa  133  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  25.66 
 
 		 456 aa  131  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  26.05 
 
 		 419 aa  127  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  27.36 
 
 		 455 aa  126  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  26.49 
 
 		 460 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  26.57 
 
 		 419 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  25.41 
 
 		 427 aa  123  6e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  24.66 
 
 		 444 aa  123  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  25.69 
 
 		 448 aa  121  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  26.16 
 
 		 419 aa  121  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2362  outer membrane efflux protein  25.22 
 
 		 446 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  21.85 
 
 		 441 aa  118  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  26.85 
 
 		 449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  24.28 
 
 		 471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  22.08 
 
 		 443 aa  116  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  26.11 
 
 		 491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  26.91 
 
 		 446 aa  113  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.04 
 
 		 1470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  24.54 
 
 		 444 aa  111  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  23.11 
 
 		 454 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  25.72 
 
 		 423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  21.49 
 
 		 471 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  25.44 
 
 		 441 aa  110  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  23.99 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  26.41 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 464 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  26.64 
 
 		 447 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 455 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 		 426 aa  106  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  25.3 
 
 		 471 aa  103  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2647  outer membrane efflux protein  23.18 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.910769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  26.19 
 
 		 447 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  24 
 
 		 439 aa  100  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 453 aa  98.2  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2662  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 		 445 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3124  outer membrane efflux protein  24.59 
 
 		 448 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 424 aa  96.3  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  25.36 
 
 		 435 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  26.98 
 
 		 459 aa  95.1  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.65 
 
 		 478 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1951  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.21 
 
 		 480 aa  93.2  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.52 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  23.98 
 
 		 437 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.8 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  22.3 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  22.35 
 
 		 488 aa  91.3  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 444 aa  91.7  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  25.11 
 
 		 470 aa  91.3  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  23.2 
 
 		 421 aa  91.3  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  21.96 
 
 		 408 aa  90.5  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1698  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 		 433 aa  90.1  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572085  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0121  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.45 
 
 		 469 aa  89.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  24.47 
 
 		 482 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.17 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1759  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.23 
 
 		 600 aa  89  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000901075  normal  0.0327712 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  22.69 
 
 		 421 aa  89.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 731 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.89 
 
 		 512 aa  88.2  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.82 
 
 		 485 aa  87.8  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  24.24 
 
 		 476 aa  87.8  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1407  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.38 
 
 		 451 aa  87.4  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 		 443 aa  86.7  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1577  outer membrane efflux protein, OprM  23.75 
 
 		 606 aa  86.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000543553  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  23.56 
 
 		 503 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.43 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.88 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6823  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.41 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248499 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.43 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1145  anibiotic ABC transporter efflux pump  24.87 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.82 
 
 		 480 aa  84  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  23.59 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4294  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190007  normal  0.396606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4543  outer membrane efflux protein  24.57 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781416  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  22.67 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1531  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 472 aa  83.2  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  22.4 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3184  outer membrane efflux protein  22.83 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0733975  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  23.95 
 
 		 972 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.23 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>