209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1131 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  96.94 
 
 		 408 aa  697    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1131  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 364 aa  729    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  20.93 
 
 		 535 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  21.08 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  22.13 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  24.17 
 
 		 447 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  24.37 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  23.65 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  22.05 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  20.47 
 
 		 463 aa  67  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  23.29 
 
 		 448 aa  67  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 471 aa  66.6  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  22.85 
 
 		 496 aa  66.2  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  21.92 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  22.32 
 
 		 470 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  21.18 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  23.78 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  23.4 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  21.52 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  20.7 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2560  outer membrane efflux protein  24.36 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  21.86 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  22.04 
 
 		 1496 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  22.48 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.89 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  22.58 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  21.26 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  23.12 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  23.55 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  21.51 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  21.52 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  22.26 
 
 		 463 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  24.57 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  22.26 
 
 		 456 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  21 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  21.32 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  23.65 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  22.16 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.71 
 
 		 489 aa  57.4  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  20.62 
 
 		 449 aa  57  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 451 aa  57  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  23.12 
 
 		 470 aa  57  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  20.28 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  23.28 
 
 		 464 aa  56.2  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.35 
 
 		 489 aa  56.2  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  22.1 
 
 		 419 aa  56.2  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.66 
 
 		 494 aa  56.2  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  23.28 
 
 		 464 aa  56.2  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  18.77 
 
 		 488 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  23.12 
 
 		 448 aa  56.2  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 		 451 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  21.93 
 
 		 497 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 454 aa  55.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  20.15 
 
 		 471 aa  54.3  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  23.99 
 
 		 494 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  21.43 
 
 		 453 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  19.82 
 
 		 485 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.71 
 
 		 471 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.71 
 
 		 471 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  23.36 
 
 		 465 aa  53.5  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  22.34 
 
 		 421 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.99 
 
 		 470 aa  53.5  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.52 
 
 		 452 aa  52.8  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  20.58 
 
 		 443 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  22.97 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1991  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.07 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.533391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  20 
 
 		 472 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  23.05 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  23.89 
 
 		 452 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.79 
 
 		 487 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  24.29 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.36 
 
 		 456 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  22.11 
 
 		 436 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  22.22 
 
 		 574 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  22.22 
 
 		 574 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  21.25 
 
 		 489 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.4 
 
 		 472 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  21.25 
 
 		 489 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  21.25 
 
 		 489 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  21.25 
 
 		 489 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  22.39 
 
 		 443 aa  50.4  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5237  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  19.88 
 
 		 516 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776503  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  22.18 
 
 		 463 aa  50.4  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  21.25 
 
 		 489 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  20.71 
 
 		 445 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  22.32 
 
 		 498 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  22.55 
 
 		 446 aa  50.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  18.98 
 
 		 441 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.76 
 
 		 455 aa  50.4  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  28.03 
 
 		 463 aa  50.1  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  22.87 
 
 		 435 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  21.5 
 
 		 1470 aa  49.7  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1581  outer membrane efflux protein  20.75 
 
 		 454 aa  50.1  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  22.35 
 
 		 435 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  20.66 
 
 		 432 aa  49.7  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000929322  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2077  outer membrane efflux protein  21.95 
 
 		 580 aa  49.7  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.668276 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  21.7 
 
 		 435 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>