204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2819 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 438 aa  881    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2560  outer membrane efflux protein  58.89 
 
 		 438 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  30.55 
 
 		 443 aa  176  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  28.24 
 
 		 455 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  28.51 
 
 		 453 aa  162  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  26.23 
 
 		 449 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  27.78 
 
 		 448 aa  160  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  27.25 
 
 		 442 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2662  outer membrane efflux protein  29.8 
 
 		 445 aa  156  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  28.12 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  28.54 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  27.78 
 
 		 444 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  28.64 
 
 		 455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  25.79 
 
 		 441 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  28.38 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  27.61 
 
 		 443 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2515  outer membrane protein  26.1 
 
 		 463 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  22.86 
 
 		 456 aa  103  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2647  outer membrane efflux protein  23.48 
 
 		 445 aa  99  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.910769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2362  outer membrane efflux protein  24.87 
 
 		 446 aa  97.1  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  23.21 
 
 		 454 aa  96.3  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  23.73 
 
 		 470 aa  92.4  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1841  Outer membrane protein-like protein  25.13 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  22.45 
 
 		 483 aa  90.1  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.29 
 
 		 467 aa  90.1  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  21.62 
 
 		 463 aa  86.7  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4543  outer membrane efflux protein  26 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781416  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  23.96 
 
 		 496 aa  82  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  21.83 
 
 		 535 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  23.78 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  20 
 
 		 462 aa  76.6  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  23.84 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  21.58 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1131  outer membrane efflux protein  23.65 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  23.37 
 
 		 503 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  23.57 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3306  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.32 
 
 		 474 aa  67.4  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  22.77 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 1496 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  23.62 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  22.42 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  24.32 
 
 		 569 aa  63.2  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  21.41 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  22.9 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  21.93 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  21.36 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4284  Outer membrane protein-like protein  22.97 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1000  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495217  normal  0.0302884 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3360  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.18 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414328  hitchhiker  0.00000000121747 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3983  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462123  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  21.11 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  21.1 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  26.74 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  25.16 
 
 		 627 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  21.7 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  20.85 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  23.49 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2559  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 445 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3998  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.46 
 
 		 484 aa  57  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  21.53 
 
 		 565 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  21.24 
 
 		 972 aa  56.6  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0617  outer membrane efflux protein  20.82 
 
 		 447 aa  56.6  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4288  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.56 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.22095  normal  0.428638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  24.35 
 
 		 499 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 		 456 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  22.42 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  22.26 
 
 		 470 aa  55.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 		 463 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2191  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.56 
 
 		 490 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.204067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  21.75 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3836  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.33 
 
 		 471 aa  53.5  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4969  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.21 
 
 		 497 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3191  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.21 
 
 		 497 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  20.87 
 
 		 460 aa  53.5  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.56 
 
 		 472 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.79 
 
 		 525 aa  53.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0689129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.06 
 
 		 457 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  21.88 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0471  efflux ABC transporter outer membrane protein  24.77 
 
 		 484 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3601  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.52 
 
 		 499 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.869969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  24.07 
 
 		 498 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0834  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  25.74 
 
 		 460 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1570  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.83 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  21.3 
 
 		 420 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 449 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1142  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.52 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258577  normal  0.581397 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  21.35 
 
 		 421 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  20.13 
 
 		 463 aa  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  21.94 
 
 		 458 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4114  outer membrane efflux protein  27.84 
 
 		 519 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  normal  0.0282956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2428  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.79 
 
 		 509 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.440095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4902  outer membrane efflux protein  23.92 
 
 		 439 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4898  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.75 
 
 		 484 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  24.45 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  27.84 
 
 		 515 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3082  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.44 
 
 		 536 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000116407 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3821  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.75 
 
 		 484 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.467284  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02156  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  22.76 
 
 		 483 aa  50.4  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.910807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>