More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0456 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  100 
 
 
463 aa  739    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  98.3 
 
 
455 aa  744    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  100 
 
 
456 aa  882    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  64.9 
 
 
497 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  49.62 
 
 
454 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2391  outer membrane efflux protein  49.51 
 
 
454 aa  277  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0837575  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1477  outer membrane efflux protein  49.16 
 
 
454 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2780  outer membrane efflux protein  43.88 
 
 
477 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2685  outer membrane efflux protein  43.36 
 
 
477 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.121287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1186  outer membrane efflux protein  43.21 
 
 
480 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.132692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3110  outer membrane efflux protein  33.16 
 
 
443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3219  outer membrane efflux protein  34.19 
 
 
440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0891  outer membrane efflux protein  33.67 
 
 
508 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116406  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3304  outer membrane efflux protein  33.94 
 
 
440 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.85963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  23.22 
 
 
471 aa  99.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  28.32 
 
 
491 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 
427 aa  91.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  20.8 
 
 
501 aa  89  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  23 
 
 
443 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  25.52 
 
 
441 aa  86.3  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  26.06 
 
 
498 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  26.54 
 
 
443 aa  85.1  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  27.92 
 
 
441 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  26.54 
 
 
453 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  27.75 
 
 
453 aa  81.3  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  27.34 
 
 
565 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  25.94 
 
 
445 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  25.84 
 
 
441 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  25.31 
 
 
463 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  23.56 
 
 
419 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  24.56 
 
 
462 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  25.52 
 
 
441 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 
458 aa  77.4  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2193  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.82 
 
 
495 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0126086  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 
635 aa  75.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  21.56 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  26.49 
 
 
448 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0171  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.17 
 
 
490 aa  74.7  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  25.52 
 
 
442 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  22.73 
 
 
448 aa  74.7  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  25.31 
 
 
471 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  28.28 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  25.06 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  27.49 
 
 
444 aa  74.7  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 
463 aa  73.9  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  28.81 
 
 
447 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  24.64 
 
 
440 aa  73.6  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.69 
 
 
449 aa  73.2  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  25.25 
 
 
438 aa  73.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  25.58 
 
 
731 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  26.05 
 
 
454 aa  72.8  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 
463 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2180  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.48 
 
 
874 aa  72.4  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000461522  normal  0.954774 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0574  outer membrane efflux protein  22.26 
 
 
427 aa  72.4  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  26.76 
 
 
472 aa  71.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  26.86 
 
 
517 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  23.84 
 
 
453 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  23.67 
 
 
419 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  24.21 
 
 
467 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  28.08 
 
 
441 aa  69.7  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2662  outer membrane efflux protein  23.02 
 
 
445 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  24.81 
 
 
523 aa  68.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3274  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.17 
 
 
495 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  26.59 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3793  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.44 
 
 
495 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.06 
 
 
497 aa  67  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1990  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.19 
 
 
513 aa  67  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  26.28 
 
 
435 aa  66.6  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  23.49 
 
 
496 aa  66.6  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  26.78 
 
 
446 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  28.33 
 
 
447 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.59 
 
 
1496 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  28.21 
 
 
458 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  23.78 
 
 
470 aa  65.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1393  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.86 
 
 
461 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  26.79 
 
 
459 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3360  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.8 
 
 
494 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414328  hitchhiker  0.00000000121747 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  25.21 
 
 
535 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  27.16 
 
 
578 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0360  RND family outer membrane efflux protein  23.85 
 
 
574 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  27.16 
 
 
578 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.11 
 
 
516 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 
473 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  23.91 
 
 
469 aa  64.3  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  23.85 
 
 
463 aa  64.3  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  23.5 
 
 
467 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  25.71 
 
 
460 aa  64.3  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  24.83 
 
 
419 aa  63.9  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 
471 aa  63.9  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  20.65 
 
 
408 aa  63.9  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  25 
 
 
576 aa  63.9  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.45 
 
 
477 aa  63.9  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  21.66 
 
 
444 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  27.87 
 
 
436 aa  63.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  22.99 
 
 
429 aa  63.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.94 
 
 
521 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 
443 aa  63.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  22.87 
 
 
594 aa  63.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1781  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.84 
 
 
517 aa  62.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0863506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2238  outer membrane efflux protein  26.44 
 
 
440 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>