More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1723 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 436 aa  878    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1698  outer membrane efflux protein  36.6 
 
 		 433 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572085  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  28.54 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  29.3 
 
 		 419 aa  122  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  27.73 
 
 		 419 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  28.22 
 
 		 424 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  26.84 
 
 		 419 aa  107  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  28.77 
 
 		 445 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  26.01 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  28.54 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  26.14 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  28.29 
 
 		 443 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  27.68 
 
 		 435 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  27.63 
 
 		 462 aa  94.4  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  23.43 
 
 		 462 aa  91.7  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  25.18 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 		 427 aa  87.8  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  24.02 
 
 		 1470 aa  87  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.58 
 
 		 463 aa  86.7  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 		 467 aa  87  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  23.95 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 496 aa  83.6  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 513 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  22.1 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 514 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.19 
 
 		 494 aa  82.4  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4114  outer membrane efflux protein  24.83 
 
 		 519 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  normal  0.0282956 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  27.53 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.02 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 515 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  26.46 
 
 		 447 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  23.22 
 
 		 514 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.1 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  23.22 
 
 		 514 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  23.22 
 
 		 514 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  25.59 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  24.18 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  22.36 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.33 
 
 		 497 aa  77.4  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.61 
 
 		 479 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.61 
 
 		 479 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  26.06 
 
 		 488 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.53 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  22.71 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.53 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.32 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.34 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.53 
 
 		 482 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.53 
 
 		 482 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  24.09 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.53 
 
 		 482 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  27.66 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  25.12 
 
 		 576 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.5 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  28.79 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  26.1 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.39 
 
 		 1496 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  23.28 
 
 		 436 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  26.54 
 
 		 488 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 508 aa  72.4  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.06 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  24.88 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  23.59 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  23.41 
 
 		 972 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  25.66 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4512  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 		 520 aa  70.5  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  24.62 
 
 		 515 aa  70.5  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  25.72 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2169  outer membrane toxin secretion efflux protein, putative  24.94 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1827  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.115006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  25.52 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2866  outer membrane efflux protein  20.65 
 
 		 480 aa  70.1  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0685652 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 635 aa  70.1  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  25.26 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.83 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  23.32 
 
 		 485 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.19 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.96 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.89 
 
 		 468 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  26.02 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  26.02 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  24.74 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  24.68 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.8 
 
 		 470 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  24.94 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.32 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.98 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.98 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  24.4 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  23.24 
 
 		 442 aa  67  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.04 
 
 		 472 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.66 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1789  outer membrane efflux protein  27.51 
 
 		 493 aa  66.6  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  26.01 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  26.01 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>