More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2799 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  100 
 
 
435 aa  897    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  47.06 
 
 
461 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  47.06 
 
 
482 aa  364  1e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  43.29 
 
 
453 aa  356  5e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  44.42 
 
 
439 aa  356  5e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  38.65 
 
 
476 aa  289  7e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  28.81 
 
 
471 aa  150  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  28.29 
 
 
491 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  26.5 
 
 
426 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  26.99 
 
 
449 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  26.35 
 
 
431 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 
427 aa  105  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.29 
 
 
441 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  23.18 
 
 
471 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  25.91 
 
 
435 aa  99.8  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  29.61 
 
 
627 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 
420 aa  98.2  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  24.41 
 
 
565 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 
417 aa  92.4  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  25.61 
 
 
431 aa  92  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  22.6 
 
 
423 aa  91.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  26.65 
 
 
459 aa  91.3  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  23.99 
 
 
525 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 
458 aa  90.1  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  24.43 
 
 
421 aa  89.7  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  27.52 
 
 
447 aa  89.7  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  26.85 
 
 
436 aa  89.7  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  27.19 
 
 
447 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
635 aa  88.2  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 
435 aa  87.8  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  26.56 
 
 
421 aa  87.4  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  21.14 
 
 
425 aa  87  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  24.36 
 
 
731 aa  86.7  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 
418 aa  86.7  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  24.06 
 
 
437 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  26.25 
 
 
445 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  24.14 
 
 
972 aa  84.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.24 
 
 
445 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  23.64 
 
 
446 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1525  outer membrane efflux protein  23.88 
 
 
442 aa  81.6  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000580745  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  25.91 
 
 
440 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  25.67 
 
 
497 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 
578 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 
578 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 
462 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  25.82 
 
 
436 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  26.13 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  22.76 
 
 
483 aa  78.2  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  24.32 
 
 
424 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  24.01 
 
 
463 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  24.66 
 
 
424 aa  76.6  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  24.03 
 
 
508 aa  76.3  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  24.94 
 
 
453 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  25 
 
 
470 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  26.49 
 
 
535 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  23.59 
 
 
497 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  23.01 
 
 
462 aa  75.1  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  25.06 
 
 
576 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  22.72 
 
 
471 aa  73.6  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  23.46 
 
 
440 aa  73.2  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 
443 aa  73.2  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  21.59 
 
 
448 aa  72.4  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.04 
 
 
467 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  23.64 
 
 
438 aa  72.4  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  21.53 
 
 
419 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  19.69 
 
 
463 aa  71.2  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  21.02 
 
 
458 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0574  outer membrane efflux protein  21.09 
 
 
427 aa  70.5  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  25.33 
 
 
454 aa  70.1  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  21.95 
 
 
470 aa  69.7  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0617  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 
447 aa  69.7  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  24.2 
 
 
436 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.76 
 
 
444 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  21.77 
 
 
441 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  24.56 
 
 
500 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.23 
 
 
457 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 
441 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  22.92 
 
 
441 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  21.56 
 
 
437 aa  66.6  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.39 
 
 
497 aa  66.2  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  19.51 
 
 
503 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.49 
 
 
468 aa  66.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2713  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.84 
 
 
477 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  23.74 
 
 
472 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0134  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.89 
 
 
450 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675891  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  22.68 
 
 
445 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  23.74 
 
 
460 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.08 
 
 
452 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.5 
 
 
456 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  20.64 
 
 
438 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.91 
 
 
452 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 
496 aa  64.7  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  21.33 
 
 
448 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.06 
 
 
562 aa  64.3  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4294  outer membrane efflux protein  24.38 
 
 
448 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190007  normal  0.396606 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0806  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 
462 aa  63.9  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.84 
 
 
452 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.81 
 
 
449 aa  63.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  21.79 
 
 
433 aa  63.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>