More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2950 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  98.12 
 
 
482 aa  941    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  98.09 
 
 
471 aa  925    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  98.12 
 
 
479 aa  941    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  98.54 
 
 
479 aa  945    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  100 
 
 
479 aa  959    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  98.12 
 
 
482 aa  942    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  98.3 
 
 
471 aa  928    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  98.12 
 
 
482 aa  942    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  64.58 
 
 
476 aa  514  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  43.48 
 
 
488 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  45.48 
 
 
471 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  45 
 
 
472 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  39.3 
 
 
452 aa  296  5e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  42.16 
 
 
462 aa  286  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  39.1 
 
 
485 aa  285  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  36.56 
 
 
495 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  37.8 
 
 
488 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  31.72 
 
 
528 aa  172  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5155  outer membrane efflux protein  35.42 
 
 
481 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239334  normal  0.865316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5005  outer membrane efflux protein  36.16 
 
 
485 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.844775 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  30.02 
 
 
738 aa  151  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  28.22 
 
 
476 aa  138  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  28.22 
 
 
476 aa  138  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1827  outer membrane efflux protein  29.22 
 
 
496 aa  127  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.115006  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2169  outer membrane toxin secretion efflux protein, putative  29.22 
 
 
496 aa  127  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  28.67 
 
 
508 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  30.3 
 
 
515 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  28.67 
 
 
453 aa  126  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  28.67 
 
 
453 aa  126  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2121  Outer membrane efflux protein  29.59 
 
 
509 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1789  outer membrane efflux protein  33.15 
 
 
493 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4114  outer membrane efflux protein  30.5 
 
 
519 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  normal  0.0282956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  30.77 
 
 
514 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  30.77 
 
 
514 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  30.77 
 
 
514 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  30.39 
 
 
513 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  30.75 
 
 
514 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0193  outer membrane efflux protein  29.98 
 
 
527 aa  118  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.339929  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1858  outer membrane efflux protein  31.84 
 
 
490 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.514737  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1943  outer membrane efflux protein  31.57 
 
 
490 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.261377  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2191  outer membrane efflux protein  29.07 
 
 
508 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  28.73 
 
 
576 aa  109  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0239  outer membrane efflux protein  28.01 
 
 
521 aa  107  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368646  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4512  outer membrane efflux protein  30.17 
 
 
520 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2020  outer membrane efflux protein  31.04 
 
 
492 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4354  Outer membrane efflux protein  30.34 
 
 
517 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  26.87 
 
 
472 aa  100  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.07 
 
 
512 aa  97.8  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  25.41 
 
 
419 aa  97.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.35 
 
 
427 aa  96.7  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  24.47 
 
 
423 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.83 
 
 
452 aa  95.1  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.93 
 
 
446 aa  94.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.92 
 
 
491 aa  92.8  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  28.21 
 
 
419 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  23.74 
 
 
420 aa  91.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 
419 aa  91.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  25.32 
 
 
452 aa  90.1  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.46 
 
 
442 aa  86.7  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.94 
 
 
493 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.53 
 
 
480 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.14 
 
 
469 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.17 
 
 
505 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  29.16 
 
 
447 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  29.16 
 
 
447 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  24.42 
 
 
464 aa  83.2  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  24.11 
 
 
494 aa  83.2  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  24.42 
 
 
464 aa  83.2  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  25.24 
 
 
635 aa  83.2  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  25.28 
 
 
465 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  28.09 
 
 
485 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  27.76 
 
 
470 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.75 
 
 
478 aa  82  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.75 
 
 
480 aa  82  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.48 
 
 
525 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  22.96 
 
 
435 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 
470 aa  81.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.59 
 
 
504 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  27.81 
 
 
485 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  27.05 
 
 
463 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1834  multidrug efflux outer membrane protein EefC  26.14 
 
 
457 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000044393 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  29.11 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.12 
 
 
442 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0710  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.89 
 
 
515 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437206  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.24 
 
 
489 aa  79.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2321  putative secretion protein  32.07 
 
 
461 aa  79.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.82 
 
 
507 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.37 
 
 
499 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6027  nodulation protein T precursor  26.24 
 
 
483 aa  79.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  28.87 
 
 
440 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  26.05 
 
 
424 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.63 
 
 
450 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.12 
 
 
453 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.06 
 
 
452 aa  79  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  23.46 
 
 
489 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1929  multidrug efflux outer membrane protein EefC  25.48 
 
 
457 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000583054 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  21.88 
 
 
497 aa  78.2  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  23.22 
 
 
489 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  23.22 
 
 
489 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  23.22 
 
 
489 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>