More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5330 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 429 aa  878    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4412  outer membrane efflux protein  35.39 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 441 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  26.95 
 
 		 443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  26.76 
 
 		 457 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  24.23 
 
 		 470 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.17 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  23.94 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  27.67 
 
 		 576 aa  84  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  23.48 
 
 		 1496 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  25.25 
 
 		 485 aa  81.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  22.68 
 
 		 476 aa  80.1  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  22.84 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  22.68 
 
 		 476 aa  80.1  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  22.41 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0943  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.28 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  21.45 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  24.11 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 528 aa  74.7  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  24.43 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  20.91 
 
 		 455 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  23.5 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  25.07 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  20.31 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3447  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.54 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 738 aa  70.5  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 449 aa  69.7  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  20.05 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  25.28 
 
 		 472 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.08 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.8 
 
 		 470 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  21.12 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  22.08 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.88 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.19 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2362  outer membrane efflux protein  27.5 
 
 		 446 aa  67  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.62 
 
 		 479 aa  67  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.51 
 
 		 497 aa  67  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.33 
 
 		 463 aa  67  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  21.77 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0979  outer membrane efflux protein  26.58 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1364  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.37 
 
 		 500 aa  66.6  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424146 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  26.02 
 
 		 731 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  23.7 
 
 		 462 aa  66.6  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.62 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.62 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.62 
 
 		 479 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.62 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.62 
 
 		 471 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.62 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.48 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3811  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.13 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.521708  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  19.76 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  23.94 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.49 
 
 		 485 aa  63.9  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  21.63 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  22.45 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  22.45 
 
 		 456 aa  63.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  25.38 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  22.3 
 
 		 485 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  25.83 
 
 		 497 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2515  outer membrane protein  20.51 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  21.76 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.06 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  23.31 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  22.04 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1300  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.54 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.634439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1872  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.14 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3378  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.45 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.469197 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.08 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  22.8 
 
 		 497 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6550  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.61 
 
 		 561 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1275  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.13 
 
 		 590 aa  60.1  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  22.49 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2564  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.38 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  21.53 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2318  outer membrane protein  21.53 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  22.96 
 
 		 1470 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.35 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1281  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.61 
 
 		 561 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.183207  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4181  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.49 
 
 		 501 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4293  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.49 
 
 		 501 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  23.08 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  27.52 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  22.65 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  22.11 
 
 		 523 aa  58.9  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  20.95 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  23.08 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  21.84 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1667  outer membrane efflux protein  21.39 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03144  putative outer membrane CHANEL lipoprotein transmembrane  21.95 
 
 		 508 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.330645 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6156  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.36 
 
 		 560 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572523 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  25.09 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>