More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1282 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 446 aa  868    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  26.93 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  28.95 
 
 		 438 aa  108  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  29.66 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  26.47 
 
 		 491 aa  103  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.53 
 
 		 428 aa  103  9e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  27.32 
 
 		 419 aa  100  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  25.85 
 
 		 476 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.65 
 
 		 1496 aa  99.8  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 		 419 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  27.17 
 
 		 420 aa  97.1  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.12 
 
 		 455 aa  94  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  27.4 
 
 		 461 aa  93.6  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.67 
 
 		 489 aa  93.6  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.56 
 
 		 472 aa  92  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003047  type I secretion TolC precursor  24.18 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  26.75 
 
 		 449 aa  90.9  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.75 
 
 		 464 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 419 aa  87.4  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 460 aa  87.4  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  24.57 
 
 		 462 aa  87.4  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.3 
 
 		 522 aa  87  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  28.92 
 
 		 456 aa  86.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  27.58 
 
 		 454 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  24.02 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0685  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 		 405 aa  86.3  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118649  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.08 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.08 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  28.92 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.67 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.09 
 
 		 523 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  25.95 
 
 		 498 aa  84.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.27 
 
 		 479 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.76 
 
 		 493 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.27 
 
 		 479 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  30.97 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  28.76 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.09 
 
 		 497 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  26.96 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  24.87 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.04 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.04 
 
 		 482 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.04 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.04 
 
 		 482 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.04 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.04 
 
 		 482 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.81 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1170  putative outer membrane protein TolC  25.12 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.109696  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.33 
 
 		 525 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.52 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02837  hypothetical protein  22.46 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.3 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  27.34 
 
 		 528 aa  80.5  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.48 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 425 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1946  outer membrane efflux protein  26.04 
 
 		 431 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.61 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  26.97 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1591  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.77 
 
 		 481 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000292967 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4223  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.74 
 
 		 510 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00337155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 496 aa  78.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4333  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.74 
 
 		 510 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.0805194 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  25.59 
 
 		 454 aa  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0620  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000193694  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0506  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.59 
 
 		 492 aa  78.2  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.59 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.92 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3318  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.75 
 
 		 470 aa  77.8  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  21.38 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.83 
 
 		 474 aa  77.4  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.65 
 
 		 485 aa  77.4  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3447  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.3 
 
 		 477 aa  77  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.08 
 
 		 505 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1875  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.22 
 
 		 476 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.4 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.02 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0662  outer membrane efflux protein  22.36 
 
 		 483 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.3 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.97 
 
 		 488 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  22.39 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.49 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.13 
 
 		 497 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.13 
 
 		 488 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.05 
 
 		 1470 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.94 
 
 		 489 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  27.71 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.37 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1416  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  27.85 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6027  nodulation protein T precursor  24.08 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.82 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.57 
 
 		 480 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  26.07 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.12 
 
 		 552 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193594 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.18 
 
 		 480 aa  73.6  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>