More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3620 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  99.79 
 
 
479 aa  957    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  99.58 
 
 
479 aa  955    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  98.12 
 
 
479 aa  941    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  99.79 
 
 
471 aa  939    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  99.79 
 
 
482 aa  962    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  99.79 
 
 
482 aa  962    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  100 
 
 
482 aa  963    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  99.36 
 
 
471 aa  936    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  66.45 
 
 
476 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  43.48 
 
 
488 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  43.81 
 
 
471 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  43.36 
 
 
472 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  39.53 
 
 
452 aa  298  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  42.83 
 
 
462 aa  289  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  39.1 
 
 
485 aa  280  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  38.04 
 
 
488 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  36.56 
 
 
495 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5155  outer membrane efflux protein  36.04 
 
 
481 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239334  normal  0.865316 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  33.49 
 
 
528 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5005  outer membrane efflux protein  36.38 
 
 
485 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.844775 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  30.02 
 
 
738 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  29.24 
 
 
476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  29.24 
 
 
476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  29.11 
 
 
508 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  29.11 
 
 
453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  29.11 
 
 
453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1789  outer membrane efflux protein  33.7 
 
 
493 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2169  outer membrane toxin secretion efflux protein, putative  29.05 
 
 
496 aa  127  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1827  outer membrane efflux protein  29.05 
 
 
496 aa  127  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.115006  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2121  Outer membrane efflux protein  29.59 
 
 
509 aa  126  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  30.09 
 
 
515 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4114  outer membrane efflux protein  30.28 
 
 
519 aa  120  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  normal  0.0282956 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1943  outer membrane efflux protein  31.81 
 
 
490 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.261377  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  30.32 
 
 
514 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  30.32 
 
 
514 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  30.32 
 
 
514 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  30.54 
 
 
514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  30.17 
 
 
513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1858  outer membrane efflux protein  31.81 
 
 
490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.514737  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0193  outer membrane efflux protein  29.75 
 
 
527 aa  114  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.339929  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2191  outer membrane efflux protein  28.8 
 
 
508 aa  110  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  28.76 
 
 
576 aa  108  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0239  outer membrane efflux protein  28.23 
 
 
521 aa  107  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368646  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4512  outer membrane efflux protein  29.76 
 
 
520 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2020  outer membrane efflux protein  31.28 
 
 
492 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  27.11 
 
 
472 aa  100  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4354  Outer membrane efflux protein  29.89 
 
 
517 aa  99.8  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.54 
 
 
446 aa  98.2  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.65 
 
 
427 aa  97.1  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.65 
 
 
491 aa  96.7  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.83 
 
 
512 aa  96.3  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.83 
 
 
452 aa  95.5  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  25.41 
 
 
419 aa  95.1  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  24.47 
 
 
423 aa  92.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  27.97 
 
 
419 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  25.32 
 
 
452 aa  90.5  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  26.01 
 
 
419 aa  90.1  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  23.98 
 
 
420 aa  89.7  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.75 
 
 
442 aa  87.8  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.38 
 
 
469 aa  86.7  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.82 
 
 
480 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  24.65 
 
 
464 aa  84  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  24.65 
 
 
464 aa  84  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.56 
 
 
505 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  24.35 
 
 
494 aa  84  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  25.56 
 
 
465 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.7 
 
 
493 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  27.76 
 
 
470 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1834  multidrug efflux outer membrane protein EefC  26.12 
 
 
457 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000044393 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.55 
 
 
525 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.34 
 
 
450 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.36 
 
 
499 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0710  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.12 
 
 
515 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437206  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  29.16 
 
 
447 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  23.52 
 
 
489 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  28.09 
 
 
485 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  29.07 
 
 
463 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1929  multidrug efflux outer membrane protein EefC  25.88 
 
 
457 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000583054 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  29.16 
 
 
447 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.37 
 
 
453 aa  80.1  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  23.28 
 
 
489 aa  80.1  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  23.52 
 
 
470 aa  79.7  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.1 
 
 
507 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.79 
 
 
405 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  23.28 
 
 
489 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  23.28 
 
 
489 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.52 
 
 
480 aa  79.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  23.28 
 
 
489 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.82 
 
 
504 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  22.12 
 
 
497 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  26 
 
 
489 aa  79.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.52 
 
 
478 aa  79.7  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  27.81 
 
 
485 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.03 
 
 
442 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2510  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.23 
 
 
465 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2321  putative secretion protein  32.36 
 
 
461 aa  78.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  23.29 
 
 
441 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3447  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.75 
 
 
477 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  24.61 
 
 
635 aa  77.8  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  23.1 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>