More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0186 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  100 
 
 		 485 aa  962    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  55.97 
 
 		 494 aa  514  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  56.39 
 
 		 497 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  51.91 
 
 		 497 aa  450  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.06 
 
 		 464 aa  290  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.22 
 
 		 487 aa  249  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  37.95 
 
 		 478 aa  249  9e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  37.36 
 
 		 480 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.01 
 
 		 497 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.81 
 
 		 463 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.58 
 
 		 464 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1003  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.5 
 
 		 462 aa  237  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.98 
 
 		 489 aa  237  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36 
 
 		 522 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.67 
 
 		 538 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.67 
 
 		 483 aa  235  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.17 
 
 		 460 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  37.3 
 
 		 518 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.44 
 
 		 456 aa  226  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  34.15 
 
 		 463 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.71 
 
 		 455 aa  225  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.52 
 
 		 463 aa  221  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  34.82 
 
 		 490 aa  220  6e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.31 
 
 		 461 aa  219  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.68 
 
 		 472 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  34.51 
 
 		 461 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  34.92 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.39 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  33.47 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  34.7 
 
 		 456 aa  211  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  34.38 
 
 		 472 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  34.29 
 
 		 438 aa  204  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.78 
 
 		 497 aa  203  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  36.78 
 
 		 488 aa  203  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  35.94 
 
 		 488 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.32 
 
 		 562 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  34.22 
 
 		 472 aa  196  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.14 
 
 		 553 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2024  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.97 
 
 		 465 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.79 
 
 		 462 aa  187  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1894  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.22 
 
 		 466 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170185  normal  0.445756 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1781  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.11 
 
 		 517 aa  176  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0863506  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0251  Outer membrane efflux protein  34.22 
 
 		 466 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608595  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.07 
 
 		 428 aa  173  7.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3542  type I secretion outer membrane protein, TolC family  35.52 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  35.28 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2597  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.53 
 
 		 492 aa  157  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1991  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.04 
 
 		 473 aa  156  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.533391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1445  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.73 
 
 		 460 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.40462 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1020  putative outer membrane protein TolC  28.07 
 
 		 423 aa  153  8e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.808388  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0823  Outer membrane efflux protein  28.74 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0383439  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0685  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.38 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118649  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4823  TolC family type I secretion outer membrane protein  33 
 
 		 446 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.05 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2727  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.56 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0246  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.99 
 
 		 538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.64 
 
 		 457 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.41 
 
 		 456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.16 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.9 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  28.38 
 
 		 462 aa  123  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  29.93 
 
 		 469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  29.98 
 
 		 470 aa  117  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3720  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.41 
 
 		 421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.667765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0634  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.75 
 
 		 467 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000541353  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  27.97 
 
 		 445 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  27.61 
 
 		 497 aa  113  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.84 
 
 		 501 aa  113  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.82 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.82 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.83 
 
 		 477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.19 
 
 		 524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.78 
 
 		 450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  27.17 
 
 		 442 aa  110  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  26.96 
 
 		 493 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  26.73 
 
 		 493 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.73 
 
 		 493 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  26.73 
 
 		 493 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  26.73 
 
 		 493 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.28 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  26.73 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  28.1 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  26.73 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  26.5 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.14 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  28.1 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  26.73 
 
 		 493 aa  108  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  29.26 
 
 		 494 aa  107  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.95 
 
 		 609 aa  106  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.05 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.67 
 
 		 464 aa  104  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  29.28 
 
 		 463 aa  104  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  27.36 
 
 		 489 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  26.96 
 
 		 489 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  26.96 
 
 		 489 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  26.96 
 
 		 489 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  26.96 
 
 		 489 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  28.05 
 
 		 463 aa  103  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.54 
 
 		 452 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 440 aa  103  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>