More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0207 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 523 aa  1053    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  29.74 
 
 		 453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  26.49 
 
 		 498 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  25.48 
 
 		 470 aa  106  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  25.36 
 
 		 427 aa  100  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  22.27 
 
 		 441 aa  94.4  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 		 515 aa  92  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 447 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  25.42 
 
 		 447 aa  88.6  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  26.29 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  20.5 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25.24 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  23.88 
 
 		 738 aa  81.3  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  21.9 
 
 		 473 aa  79.7  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  23.74 
 
 		 443 aa  79.7  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  21.9 
 
 		 473 aa  79.7  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  25.59 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  25.97 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  22.92 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  24.24 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  23.4 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  24.65 
 
 		 482 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.69 
 
 		 523 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  26.1 
 
 		 497 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  25.34 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  21.77 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  24.87 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  22.88 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.73 
 
 		 495 aa  74.7  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  24.42 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6208  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.73 
 
 		 497 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.842439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  21.95 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  24.94 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  26.03 
 
 		 488 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 419 aa  72  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  23.3 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  25.35 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  28.9 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  28.9 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  27.14 
 
 		 473 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  19.24 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  22.33 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  28.9 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  21.74 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  23.54 
 
 		 471 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0412  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20.94 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  23.5 
 
 		 594 aa  69.3  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  24.17 
 
 		 491 aa  68.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  25.37 
 
 		 635 aa  68.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  20.85 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  22.16 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2663  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.43 
 
 		 496 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0166  outer membrane channel lipoprotein  25.97 
 
 		 480 aa  67.4  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00297145  normal  0.496674 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 731 aa  67.4  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.17 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2371  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.14 
 
 		 482 aa  67  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.774787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  26.79 
 
 		 489 aa  67  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3110  outer membrane efflux protein  28.2 
 
 		 443 aa  66.6  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  26.79 
 
 		 489 aa  67  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  25.07 
 
 		 528 aa  66.6  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  24.29 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  23.41 
 
 		 470 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  23.87 
 
 		 972 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  26.79 
 
 		 489 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  24.32 
 
 		 498 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.83 
 
 		 525 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  20.6 
 
 		 485 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  23.19 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  25.11 
 
 		 576 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0891  outer membrane efflux protein  29.96 
 
 		 508 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  26.79 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1275  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  20.57 
 
 		 590 aa  65.1  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  25.23 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  24.09 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  21.98 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1502  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.83 
 
 		 503 aa  64.3  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.26 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2832  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.34 
 
 		 520 aa  64.3  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  26.79 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  28.51 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5589  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.5 
 
 		 498 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1747  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.04 
 
 		 496 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  26.79 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.94 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4489  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.36 
 
 		 523 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000880078  hitchhiker  0.0020567 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3360  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.79 
 
 		 494 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414328  hitchhiker  0.00000000121747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.4 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  26.79 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  25.25 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 		 435 aa  63.5  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  23.94 
 
 		 499 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.39 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.5 
 
 		 475 aa  62.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  26.89 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3318  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.56 
 
 		 470 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>