More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5589 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5589  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  100 
 
 
498 aa  990    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7008  RND efflux system outer membrane lipoprotein  65.43 
 
 
493 aa  579  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130004  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5889  RND efflux system outer membrane lipoprotein  62.45 
 
 
496 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781684  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2623  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  58.69 
 
 
494 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1031  ABC-type export system, outer membrane channel protein  58.49 
 
 
494 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  55.97 
 
 
523 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2766  outer membrane lipoprotein  58.49 
 
 
494 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.219926  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0447  RND efflux system outer membrane lipoprotein  59.54 
 
 
494 aa  500  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0433676  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1320  ABC-type export system, outer membrane channel protein  58.2 
 
 
779 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1502  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  49.89 
 
 
503 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4555  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  52.12 
 
 
491 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163677  normal  0.0686042 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4422  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  52.12 
 
 
491 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.800929  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1225  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  50.53 
 
 
487 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422386  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5328  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin ZneC  41.84 
 
 
511 aa  329  7e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.998587  normal  0.685908 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1058  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.99 
 
 
511 aa  323  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.712242  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0526  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.91 
 
 
510 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5958  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.22 
 
 
506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7713  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.25 
 
 
532 aa  320  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2409  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.9 
 
 
483 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2739  putative outer membrane efflux protein  39.39 
 
 
520 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0347  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  41.01 
 
 
488 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0166  outer membrane channel lipoprotein  42 
 
 
480 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00297145  normal  0.496674 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0055  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.02 
 
 
579 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0092  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.72 
 
 
557 aa  294  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3370  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.5 
 
 
551 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0755058  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0058  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.56 
 
 
579 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1747  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.42 
 
 
496 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319328  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1990  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.44 
 
 
513 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1356  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  39.96 
 
 
501 aa  282  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4326  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.5 
 
 
484 aa  280  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3688  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.55 
 
 
511 aa  279  7e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.595948  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0406  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.69 
 
 
500 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.05 
 
 
502 aa  276  6e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1722  ABC efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40 
 
 
421 aa  274  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248885  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0766  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.25 
 
 
480 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000618276  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3468  putative outer membrane lipoprotein (NodT-like), RND efflux system  36.75 
 
 
523 aa  272  9e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0852484  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_003296  RS02376  putative outer membrane channel lipoprotein transmembrane  40.48 
 
 
485 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.0665572 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00707  cation efflux system protein  40.9 
 
 
482 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.135104  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5321  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin ZniC  36.77 
 
 
518 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.944742 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2874  putative outer membrane protein  34.97 
 
 
504 aa  261  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.130089  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4161  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.69 
 
 
498 aa  259  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.309156 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3688  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.47 
 
 
501 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.235267  normal  0.483752 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0688  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.23 
 
 
505 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.13024 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1244  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.22 
 
 
478 aa  252  9.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1438  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.59 
 
 
514 aa  250  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115018  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2531  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.7 
 
 
484 aa  249  8e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.396658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1544  putative outer membrane lipoprotein (NodT-like), RND efflux system  35.08 
 
 
543 aa  249  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280658  normal  0.243033 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3847  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.66 
 
 
495 aa  246  6.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1255  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.66 
 
 
495 aa  246  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0685984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1915  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.66 
 
 
495 aa  246  6.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3830  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.66 
 
 
495 aa  246  6.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3299  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.79 
 
 
509 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4987  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.7 
 
 
505 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867259 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1670  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.14 
 
 
505 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.714759  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2946  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.14 
 
 
505 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2681  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.78 
 
 
491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2105  Outer membrane protein  36.72 
 
 
574 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275801  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0952  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.49 
 
 
634 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2910  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.53 
 
 
522 aa  228  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.49 
 
 
634 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2164  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  36.49 
 
 
634 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1880  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.46 
 
 
515 aa  225  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1555  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.46 
 
 
515 aa  225  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000678777  hitchhiker  0.0000000215879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2690  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.07 
 
 
485 aa  219  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.157343  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0943  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.47 
 
 
506 aa  219  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352161  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5037  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.33 
 
 
521 aa  216  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.622101 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1518  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.95 
 
 
515 aa  216  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.25718 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1741  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.33 
 
 
522 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6338  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.33 
 
 
522 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1754  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.33 
 
 
522 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2751  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.29 
 
 
480 aa  213  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124285  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1662  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.13 
 
 
532 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49733  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1662  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.94 
 
 
536 aa  210  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2287  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.15 
 
 
535 aa  207  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469139  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1267  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.27 
 
 
497 aa  206  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0196651  normal  0.750838 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1966  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.65 
 
 
498 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  decreased coverage  0.00633944 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2294  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.58 
 
 
511 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.703327  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3537  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.14 
 
 
487 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944145  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0868  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.57 
 
 
511 aa  194  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.71 
 
 
489 aa  193  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5800  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.19 
 
 
488 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.61 
 
 
487 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2428  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.2 
 
 
509 aa  179  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.440095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.85 
 
 
495 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3486  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.42 
 
 
500 aa  177  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0233233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  29.38 
 
 
498 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0569  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.56 
 
 
486 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.45 
 
 
482 aa  173  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.98 
 
 
504 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2756  outer membrane efflux protein  30.42 
 
 
490 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28780  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.63 
 
 
512 aa  172  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506262  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  29.6 
 
 
499 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.81 
 
 
496 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.39 
 
 
486 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.81 
 
 
496 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  30.15 
 
 
497 aa  172  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.05 
 
 
477 aa  171  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.321053 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3226  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.57 
 
 
503 aa  170  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303935  normal  0.0862047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4316  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30 
 
 
511 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.138583 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4291  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.36 
 
 
503 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>