More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1915 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008608  Ppro_3830  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
495 aa  973    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1915  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
495 aa  973    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3847  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
495 aa  973    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2681  RND efflux system outer membrane lipoprotein  98.38 
 
 
491 aa  855    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1255  RND efflux system outer membrane lipoprotein  99.19 
 
 
495 aa  969    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0685984  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1356  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  67.92 
 
 
501 aa  617  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2874  putative outer membrane protein  59.83 
 
 
504 aa  560  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.130089  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1244  RND efflux system outer membrane lipoprotein  52.61 
 
 
478 aa  448  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1438  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  50.61 
 
 
514 aa  421  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0526  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.05 
 
 
510 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5958  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  47.32 
 
 
506 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2409  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.77 
 
 
483 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7713  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.06 
 
 
532 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0347  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  47 
 
 
488 aa  359  7e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0868  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.57 
 
 
511 aa  344  2e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1990  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.89 
 
 
513 aa  331  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0406  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  46.34 
 
 
500 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0058  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.03 
 
 
579 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1058  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.03 
 
 
511 aa  325  9e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.712242  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0055  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.06 
 
 
579 aa  323  6e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5328  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin ZneC  41.81 
 
 
511 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.998587  normal  0.685908 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0766  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.32 
 
 
480 aa  316  7e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000618276  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.96 
 
 
523 aa  315  8e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0166  outer membrane channel lipoprotein  46.35 
 
 
480 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00297145  normal  0.496674 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1722  ABC efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.85 
 
 
421 aa  302  9e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248885  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3370  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.52 
 
 
551 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0755058  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1747  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.75 
 
 
496 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319328  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4326  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.22 
 
 
484 aa  300  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0092  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.15 
 
 
557 aa  299  7e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2623  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  42.89 
 
 
494 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1031  ABC-type export system, outer membrane channel protein  42.68 
 
 
494 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5321  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin ZniC  41.09 
 
 
518 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.944742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2531  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.74 
 
 
484 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.396658 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2766  outer membrane lipoprotein  43.09 
 
 
494 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.219926  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4987  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.74 
 
 
505 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867259 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7008  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.69 
 
 
493 aa  292  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130004  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1670  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.31 
 
 
505 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.714759  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2946  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.31 
 
 
505 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.93 
 
 
502 aa  290  4e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4422  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.77 
 
 
491 aa  289  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.800929  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4555  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.77 
 
 
491 aa  289  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163677  normal  0.0686042 
 
 
-
 
NC_003296  RS02376  putative outer membrane channel lipoprotein transmembrane  44.54 
 
 
485 aa  285  9e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.0665572 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5589  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.61 
 
 
498 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1225  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.95 
 
 
487 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422386  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0447  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.18 
 
 
494 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0433676  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5889  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.2 
 
 
496 aa  279  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781684  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2739  putative outer membrane efflux protein  38.85 
 
 
520 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1502  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.8 
 
 
503 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4161  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.08 
 
 
498 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.309156 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3688  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.08 
 
 
501 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.235267  normal  0.483752 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.43 
 
 
634 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0952  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.22 
 
 
634 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2164  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  40.22 
 
 
634 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2105  Outer membrane protein  40.22 
 
 
574 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275801  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3688  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.45 
 
 
511 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.595948  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3299  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.47 
 
 
509 aa  258  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1320  ABC-type export system, outer membrane channel protein  42.24 
 
 
779 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1518  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.51 
 
 
515 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.25718 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1754  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.76 
 
 
522 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1741  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.55 
 
 
522 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6338  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.55 
 
 
522 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5037  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.88 
 
 
521 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.622101 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1662  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.45 
 
 
532 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49733  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00707  cation efflux system protein  40.73 
 
 
482 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.135104  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1662  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.15 
 
 
536 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3468  putative outer membrane lipoprotein (NodT-like), RND efflux system  37.25 
 
 
523 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0852484  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2287  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.96 
 
 
535 aa  238  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469139  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1966  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.04 
 
 
498 aa  237  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  decreased coverage  0.00633944 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2294  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.35 
 
 
511 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.703327  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1555  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.04 
 
 
515 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000678777  hitchhiker  0.0000000215879 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1880  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.04 
 
 
515 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1267  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.61 
 
 
497 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0196651  normal  0.750838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1544  putative outer membrane lipoprotein (NodT-like), RND efflux system  37.1 
 
 
543 aa  230  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280658  normal  0.243033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2751  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.04 
 
 
480 aa  226  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124285  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2910  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.56 
 
 
522 aa  226  9e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0688  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.95 
 
 
505 aa  224  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.13024 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3537  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.43 
 
 
487 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944145  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2690  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.83 
 
 
485 aa  213  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.157343  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5276  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.23 
 
 
488 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0692924  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5800  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.8 
 
 
488 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583861 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0943  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.14 
 
 
506 aa  204  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352161  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3274  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.24 
 
 
495 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2193  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.57 
 
 
495 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0126086  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3793  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.98 
 
 
495 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.09 
 
 
489 aa  170  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.12 
 
 
488 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6612  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.61 
 
 
508 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.660078 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0109  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.79 
 
 
519 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3186  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.64 
 
 
502 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753905  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0108  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.79 
 
 
519 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1393  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.98 
 
 
461 aa  163  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.88 
 
 
495 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.18 
 
 
495 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3628  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.18 
 
 
495 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.615306 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4467  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.18 
 
 
495 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419427  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  26.45 
 
 
479 aa  160  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.94 
 
 
487 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0569  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.79 
 
 
486 aa  160  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.66 
 
 
477 aa  159  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.321053 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1595  multidrug efflux system outer membrane subunit  30.99 
 
 
520 aa  159  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>