More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3378 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 498 aa  999    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  31.81 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  30.22 
 
 		 446 aa  138  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  27.13 
 
 		 523 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  23.31 
 
 		 425 aa  97.4  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  24.59 
 
 		 419 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.28 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  24.8 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  22.8 
 
 		 515 aa  80.5  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  26.75 
 
 		 491 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  19.27 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  24.57 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  24.64 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  25.44 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  23.54 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  23.58 
 
 		 488 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  26.2 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  22.73 
 
 		 528 aa  73.9  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  24.19 
 
 		 441 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  24.15 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  24.75 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  22.51 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  22.5 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  24.4 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  24.43 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  24.64 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 440 aa  70.1  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  24.41 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3219  outer membrane efflux protein  27.32 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  19.42 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  23.63 
 
 		 419 aa  67  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 420 aa  67  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1341  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.45 
 
 		 477 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 		 473 aa  65.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 		 473 aa  65.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.62 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  24.11 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  22.66 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4169  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.92 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2298  outer membrane efflux protein  24.62 
 
 		 525 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  22.38 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  26.32 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2912  hypothetical protein  25.23 
 
 		 533 aa  63.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  23.81 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  25.8 
 
 		 738 aa  63.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20.64 
 
 		 523 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3110  outer membrane efflux protein  27.08 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  24.93 
 
 		 500 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.85 
 
 		 472 aa  62  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  22.09 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2815  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  23.96 
 
 		 502 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.449733 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3304  outer membrane efflux protein  27.55 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.85963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  19.6 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  22.86 
 
 		 496 aa  62.4  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01780  outer membrane CHANEL lipoprotein  25.25 
 
 		 522 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.67 
 
 		 504 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.83 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  21.36 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  24.31 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.98 
 
 		 514 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1056  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.98 
 
 		 498 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0170  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.98 
 
 		 498 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0737823  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.59 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0996  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.98 
 
 		 498 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  23.12 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.68 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1968  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.27 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1768  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  25.61 
 
 		 493 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.98 
 
 		 514 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330678  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1724  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.38 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  21.7 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0891  outer membrane efflux protein  30.49 
 
 		 508 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1745  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  25.61 
 
 		 498 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134149  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.68 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1637  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.17 
 
 		 502 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.774452  hitchhiker  0.00150735 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.68 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5589  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.56 
 
 		 498 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.68 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3582  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  25.12 
 
 		 502 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.68 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  23.73 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.82 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.42 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3003  outer membrane efflux protein  22 
 
 		 816 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  21.59 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2121  Outer membrane efflux protein  25.08 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0935  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.77 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.219048  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.3 
 
 		 527 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2259  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.35 
 
 		 508 aa  57.4  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2544  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.81 
 
 		 467 aa  57  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.109213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0887  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.53 
 
 		 586 aa  57  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000421492  hitchhiker  0.0000263613 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.07 
 
 		 479 aa  57  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4294  outer membrane efflux protein  29.08 
 
 		 448 aa  57  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190007  normal  0.396606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>