More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0391 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  100 
 
 		 437 aa  862    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  71.43 
 
 		 446 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  50.91 
 
 		 458 aa  430  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  51.53 
 
 		 447 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  51.29 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  48.71 
 
 		 448 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  25.45 
 
 		 458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 		 463 aa  124  4e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  27.04 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  27.15 
 
 		 441 aa  116  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  26.95 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  26 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  23.13 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  26.73 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  26.81 
 
 		 461 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  30.61 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 515 aa  104  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  24.15 
 
 		 440 aa  103  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 441 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  25.76 
 
 		 445 aa  103  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  26.49 
 
 		 435 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  28.08 
 
 		 419 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  28.15 
 
 		 419 aa  99.8  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  27.36 
 
 		 421 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  26.87 
 
 		 421 aa  97.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  29.27 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  26.07 
 
 		 439 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  26.77 
 
 		 426 aa  93.6  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 417 aa  93.2  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 482 aa  93.2  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  26.85 
 
 		 453 aa  93.2  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 		 435 aa  92.8  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  23.98 
 
 		 470 aa  91.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  27 
 
 		 420 aa  90.1  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  26.97 
 
 		 473 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  26.97 
 
 		 473 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.98 
 
 		 471 aa  87.8  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 467 aa  87.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  25.79 
 
 		 419 aa  87.4  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  27.23 
 
 		 436 aa  86.7  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  24.41 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  26.04 
 
 		 523 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  24.51 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  22.44 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  24.34 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  28.31 
 
 		 470 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3941  outer membrane efflux protein  29.81 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  26.32 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  28.05 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  27.67 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  27.72 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  28.85 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  30.16 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  23.13 
 
 		 441 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  22.43 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  27.25 
 
 		 462 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  25.35 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  24.71 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  26.59 
 
 		 972 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  22.51 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  29.97 
 
 		 497 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4051  outer membrane efflux protein  29.78 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.337744  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4084  outer membrane efflux protein  29.78 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4294  outer membrane efflux protein  27.74 
 
 		 448 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190007  normal  0.396606 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  25.94 
 
 		 462 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.18 
 
 		 495 aa  71.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  25.51 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  20.05 
 
 		 451 aa  70.9  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1690  outer membrane efflux protein  27.03 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0141  RND efflux system, outer membrane protein  28.38 
 
 		 506 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  22.84 
 
 		 489 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  30.53 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1037  RND efflux system, outer membrane protein  28.38 
 
 		 508 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0168  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  28.38 
 
 		 508 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618806  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.82 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1312  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  28.38 
 
 		 508 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2631  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  28.38 
 
 		 508 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  26.3 
 
 		 501 aa  68.9  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1948  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.56 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  24.04 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  24.72 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2774  Outer membrane protein  28.38 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 498 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  22.56 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0617  outer membrane efflux protein  24.83 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0440  RND efflux system, outer membrane protein  26.82 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  24.1 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  26.96 
 
 		 446 aa  67  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.33 
 
 		 471 aa  67  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 496 aa  66.6  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.26 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 		 497 aa  66.6  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  25.36 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.88 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.17 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  24.78 
 
 		 500 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.99 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  22.07 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  26.77 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>