More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2121 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2191  outer membrane efflux protein  68.99 
 
 		 508 aa  649    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2121  Outer membrane efflux protein  100 
 
 		 509 aa  1013    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  56.94 
 
 		 514 aa  535  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4512  outer membrane efflux protein  58.03 
 
 		 520 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  56.24 
 
 		 514 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  56.24 
 
 		 514 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  56.24 
 
 		 514 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  55.65 
 
 		 513 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  55.6 
 
 		 515 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4114  outer membrane efflux protein  55.6 
 
 		 519 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  normal  0.0282956 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4354  Outer membrane efflux protein  56.94 
 
 		 517 aa  504  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0193  outer membrane efflux protein  52.05 
 
 		 527 aa  504  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.339929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0239  outer membrane efflux protein  48.44 
 
 		 521 aa  420  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  40.12 
 
 		 508 aa  335  7.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  40.4 
 
 		 453 aa  311  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  40.62 
 
 		 453 aa  312  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1760  hypothetical protein  60.43 
 
 		 721 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1600  outer membrane efflux protein  53.23 
 
 		 295 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.44 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  28.57 
 
 		 462 aa  121  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1371  outer membrane efflux protein  60 
 
 		 269 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0644375  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0503  putative outer membrane protein  60 
 
 		 269 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.39 
 
 		 479 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.39 
 
 		 482 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.39 
 
 		 479 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.39 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.39 
 
 		 482 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.39 
 
 		 482 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.14 
 
 		 471 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.39 
 
 		 479 aa  107  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  23.14 
 
 		 485 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  27.97 
 
 		 528 aa  104  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  27.33 
 
 		 738 aa  104  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  26.28 
 
 		 488 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  27.39 
 
 		 488 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  25.44 
 
 		 476 aa  97.1  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  25.44 
 
 		 476 aa  97.1  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  26.36 
 
 		 500 aa  94.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 476 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  24.77 
 
 		 471 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25.58 
 
 		 419 aa  90.5  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 495 aa  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.69 
 
 		 546 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16116  normal  0.32958 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2169  outer membrane toxin secretion efflux protein, putative  26.36 
 
 		 496 aa  88.2  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1827  outer membrane efflux protein  26.36 
 
 		 496 aa  88.2  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.115006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1789  outer membrane efflux protein  29.45 
 
 		 493 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1943  outer membrane efflux protein  31.21 
 
 		 490 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.261377  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1858  outer membrane efflux protein  30.92 
 
 		 490 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.514737  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  25.5 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  24.26 
 
 		 472 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.32 
 
 		 517 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  23.44 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.12 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2756  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.99 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0415066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2510  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.71 
 
 		 465 aa  76.6  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  23.34 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.45 
 
 		 495 aa  75.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1346  aromatic acid efflux system, outer membrane lipoprotein  25.66 
 
 		 514 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  23.96 
 
 		 465 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.35 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  23.96 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  23.96 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.62 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  24.43 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.94 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  23.72 
 
 		 731 aa  70.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2781  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.73 
 
 		 604 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2568  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.77 
 
 		 482 aa  70.1  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1840  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.72 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  24.32 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3584  outer membrane protein oprM  27.68 
 
 		 468 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.68 
 
 		 468 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  25.48 
 
 		 627 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04010  RND efflux system, outer membrane lipoprotein  23.08 
 
 		 504 aa  67  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174506  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2841  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.7 
 
 		 482 aa  67  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3433  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.64 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.89 
 
 		 474 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.98 
 
 		 474 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4008  outer membrane protein oprM  26.45 
 
 		 468 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  24.02 
 
 		 474 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.85 
 
 		 489 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  23.75 
 
 		 576 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  24.07 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1582  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.68 
 
 		 515 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01155  outer membrane efflux protein  25.42 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269459  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0679  outer membrane efflux protein  25.3 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0368289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3931  multidrug efflux system outer membrane subunit  26.32 
 
 		 507 aa  65.1  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.25 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1124  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.79 
 
 		 509 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.405736 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60820  outer membrane protein OprJ  26.61 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.41 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2020  outer membrane efflux protein  30.73 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  23.21 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3744  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.14 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00975176  normal  0.397095 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.63 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  23.04 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2527  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.81 
 
 		 507 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3236  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.72 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  25.86 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000707781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>