More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0679 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0679  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 444 aa  910    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0368289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  25.32 
 
 		 461 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  25.54 
 
 		 444 aa  140  4.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  25.39 
 
 		 443 aa  134  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1667  outer membrane efflux protein  26.4 
 
 		 455 aa  133  5e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0662  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  25.58 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2866  outer membrane efflux protein  21.82 
 
 		 480 aa  113  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0685652 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  24.59 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 436 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  25.68 
 
 		 463 aa  100  7e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 471 aa  98.2  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1531  outer membrane efflux protein  24.27 
 
 		 472 aa  93.6  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0962  outer membrane efflux protein  20.96 
 
 		 464 aa  93.2  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000066626  normal  0.118679 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  24.88 
 
 		 500 aa  90.1  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  22.17 
 
 		 470 aa  90.1  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.23 
 
 		 444 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.23 
 
 		 444 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  23.72 
 
 		 419 aa  86.7  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1203  outer membrane efflux protein  21.03 
 
 		 497 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  23.43 
 
 		 419 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  23.65 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  22.82 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0986  outer membrane efflux protein, putative  23.78 
 
 		 484 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4897  outer membrane efflux protein  19.24 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861249  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  23.85 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2121  Outer membrane efflux protein  24.4 
 
 		 509 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.87 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  22.28 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  21.05 
 
 		 444 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  26.46 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  21.93 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  23.13 
 
 		 469 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  21.23 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.52 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  21.97 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.49 
 
 		 553 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2510  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.66 
 
 		 465 aa  68.2  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  23.46 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  23.95 
 
 		 513 aa  67  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  23.83 
 
 		 514 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  23.83 
 
 		 514 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2314  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 		 653 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.682449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  23.83 
 
 		 514 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  23.54 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  23.47 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  24.1 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  24.1 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  24.1 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2690  type I secretion outer membrane protein, putative  25.19 
 
 		 598 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  24.1 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  24.1 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  22.79 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  23.37 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.32 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.32 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  22.76 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  23.44 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 514 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  24.76 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  23.81 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  23.22 
 
 		 469 aa  63.5  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  23.38 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  24.32 
 
 		 515 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4942  outer membrane efflux protein  20.93 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755187  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4114  outer membrane efflux protein  27.63 
 
 		 519 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  normal  0.0282956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.55 
 
 		 518 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  21.75 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3333  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  21.79 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  21.94 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4182  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.1 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4184  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.1 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0785  Outer membrane efflux protein  24.37 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.32 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  23.14 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  23.55 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  22.95 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.42 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  22.65 
 
 		 494 aa  60.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  22.58 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  22.58 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  22.58 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  22.08 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  24 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.44 
 
 		 507 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1293  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  22.49 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.09 
 
 		 475 aa  59.7  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  21.28 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  21.34 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  22.57 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  20.85 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  23.55 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  24.56 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>