More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4182 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0370  putative outer membrane protein TolC  80.87 
 
 		 446 aa  744    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00192444  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0997  putative outer membrane protein TolC  77.83 
 
 		 476 aa  758    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.471122  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1327  putative outer membrane protein TolC  80.87 
 
 		 446 aa  744    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.345184  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0296  outer membrane protein TolC, putative  77.83 
 
 		 476 aa  758    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1841  outer membrane efflux protein  94.89 
 
 		 471 aa  909    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1822  putative outer membrane protein TolC  78.04 
 
 		 476 aa  757    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3333  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 438 aa  890    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1135  outer membrane protein TolC, putative  77.4 
 
 		 480 aa  753    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196284  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0269  putative outer membrane protein TolC  77.83 
 
 		 476 aa  758    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0165015  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4182  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 471 aa  962    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4184  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 471 aa  962    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1738  putative outer membrane protein TolC  79.52 
 
 		 521 aa  751    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.94 
 
 		 469 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  28.05 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.17 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  26.43 
 
 		 493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.97 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.95 
 
 		 488 aa  126  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  28.89 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.05 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  26.48 
 
 		 434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.79 
 
 		 464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  25.51 
 
 		 435 aa  120  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  26.68 
 
 		 484 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  27.15 
 
 		 435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 		 442 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  25.98 
 
 		 435 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.31 
 
 		 434 aa  117  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.68 
 
 		 453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  25.38 
 
 		 435 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  25.38 
 
 		 435 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.59 
 
 		 497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.05 
 
 		 446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.57 
 
 		 489 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  25.78 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000929322  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.8 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  25.11 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.16 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.11 
 
 		 481 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.11 
 
 		 447 aa  113  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.27 
 
 		 405 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.5 
 
 		 480 aa  113  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.86 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  24.65 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.17 
 
 		 456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.25 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  25.92 
 
 		 443 aa  110  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.83 
 
 		 491 aa  110  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  24.76 
 
 		 435 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  24.76 
 
 		 435 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  24.76 
 
 		 435 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  24.42 
 
 		 432 aa  109  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  24.76 
 
 		 435 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  27.66 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.66 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  27.66 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  26.25 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  27.66 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  27.66 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  27.66 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.45 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  27.66 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  27.83 
 
 		 493 aa  108  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  26.12 
 
 		 431 aa  108  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  27.15 
 
 		 489 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  27.15 
 
 		 489 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.88 
 
 		 477 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  27.44 
 
 		 495 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  27.15 
 
 		 489 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  27.15 
 
 		 489 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  27.15 
 
 		 489 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  26.23 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.13 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.79 
 
 		 442 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  26.16 
 
 		 494 aa  104  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.9 
 
 		 477 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2439  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.11 
 
 		 443 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.73 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.4 
 
 		 479 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.11 
 
 		 478 aa  100  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  25.12 
 
 		 479 aa  100  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  28.15 
 
 		 470 aa  99.8  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  27.14 
 
 		 440 aa  99.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 		 481 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  24.66 
 
 		 444 aa  99  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  26.12 
 
 		 464 aa  97.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1407  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.4 
 
 		 451 aa  97.4  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  26.12 
 
 		 464 aa  97.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.28 
 
 		 480 aa  97.1  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  24.84 
 
 		 462 aa  96.3  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  24.89 
 
 		 482 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  27.08 
 
 		 469 aa  95.1  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3328  ABC transporter, permease protein  25.32 
 
 		 456 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262756  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  26.79 
 
 		 465 aa  94.4  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2830  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.55 
 
 		 455 aa  94.4  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0538261  hitchhiker  0.00247347 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.26 
 
 		 446 aa  94  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  23.57 
 
 		 454 aa  94  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  24.83 
 
 		 497 aa  93.6  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.8 
 
 		 436 aa  93.2  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3077  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.65 
 
 		 491 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.762548  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>