More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A1327 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0269  putative outer membrane protein TolC  99.78 
 
 		 476 aa  914    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0165015  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0997  putative outer membrane protein TolC  99.78 
 
 		 476 aa  914    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.471122  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0296  outer membrane protein TolC, putative  99.78 
 
 		 476 aa  914    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1327  putative outer membrane protein TolC  100 
 
 		 446 aa  915    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.345184  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1822  putative outer membrane protein TolC  99.55 
 
 		 476 aa  913    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1841  outer membrane efflux protein  80.64 
 
 		 471 aa  747    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3333  outer membrane efflux protein  83.57 
 
 		 438 aa  744    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1135  outer membrane protein TolC, putative  97.76 
 
 		 480 aa  898    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196284  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0370  putative outer membrane protein TolC  100 
 
 		 446 aa  915    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00192444  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4182  outer membrane efflux protein  80.87 
 
 		 471 aa  744    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1738  putative outer membrane protein TolC  99.55 
 
 		 521 aa  910    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4184  outer membrane efflux protein  80.87 
 
 		 471 aa  744    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.48 
 
 		 478 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.18 
 
 		 488 aa  143  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  28.54 
 
 		 493 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  26.29 
 
 		 434 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  27.31 
 
 		 435 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  28.86 
 
 		 484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.81 
 
 		 469 aa  134  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.94 
 
 		 497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.55 
 
 		 434 aa  131  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  26.36 
 
 		 435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  30.23 
 
 		 437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.74 
 
 		 441 aa  127  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  25.78 
 
 		 435 aa  126  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  25.17 
 
 		 441 aa  126  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  25.78 
 
 		 435 aa  126  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  25.78 
 
 		 435 aa  126  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  26.02 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  26.3 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.03 
 
 		 442 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.48 
 
 		 461 aa  123  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.34 
 
 		 489 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  26.53 
 
 		 451 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  24.88 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  24.88 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  24.88 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  25.64 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000929322  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  24.88 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.37 
 
 		 450 aa  117  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.28 
 
 		 464 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  24.71 
 
 		 432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.91 
 
 		 446 aa  114  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.42 
 
 		 477 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  27 
 
 		 491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.83 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.54 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.31 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  25.87 
 
 		 449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.19 
 
 		 447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.79 
 
 		 480 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  23.98 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.7 
 
 		 477 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.65 
 
 		 477 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  26.17 
 
 		 442 aa  110  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.43 
 
 		 481 aa  109  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.34 
 
 		 449 aa  109  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.42 
 
 		 477 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.34 
 
 		 456 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.86 
 
 		 512 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  27.58 
 
 		 493 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.58 
 
 		 493 aa  107  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  27.58 
 
 		 493 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  27.58 
 
 		 495 aa  107  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  27.58 
 
 		 495 aa  107  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  27.58 
 
 		 493 aa  107  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  27.58 
 
 		 493 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  27.58 
 
 		 493 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  27.58 
 
 		 495 aa  107  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  25.67 
 
 		 454 aa  106  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.16 
 
 		 480 aa  106  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1407  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.13 
 
 		 451 aa  106  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  24.66 
 
 		 479 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.53 
 
 		 453 aa  106  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  25.06 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.66 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.08 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.84 
 
 		 442 aa  104  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.94 
 
 		 468 aa  103  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  24.59 
 
 		 497 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2439  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.21 
 
 		 443 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.83 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  27.58 
 
 		 470 aa  100  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  26.38 
 
 		 438 aa  100  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.39 
 
 		 446 aa  100  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  25.93 
 
 		 469 aa  100  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  24.83 
 
 		 481 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  26.98 
 
 		 494 aa  97.8  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  25.17 
 
 		 489 aa  97.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  25.84 
 
 		 482 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  23.73 
 
 		 464 aa  96.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  23.73 
 
 		 464 aa  96.7  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  26.51 
 
 		 440 aa  96.7  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  25.85 
 
 		 489 aa  96.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.33 
 
 		 450 aa  96.3  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  25.17 
 
 		 489 aa  96.3  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  25.17 
 
 		 489 aa  96.3  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  25.17 
 
 		 489 aa  96.3  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2682  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.41 
 
 		 451 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.829421  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.38 
 
 		 494 aa  95.9  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>