More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3958 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  100 
 
 
491 aa  963    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  66.99 
 
 
469 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  67.85 
 
 
405 aa  524  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  67.06 
 
 
447 aa  520  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  59.46 
 
 
512 aa  502  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  59.87 
 
 
453 aa  490  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  59.48 
 
 
450 aa  481  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  62.09 
 
 
446 aa  481  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  60.27 
 
 
442 aa  474  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  53.9 
 
 
451 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2439  TolC family type I secretion outer membrane protein  54.57 
 
 
443 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  46.28 
 
 
493 aa  316  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  44.86 
 
 
497 aa  302  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  43.09 
 
 
437 aa  298  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  46.21 
 
 
434 aa  297  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  44.11 
 
 
441 aa  290  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  43.71 
 
 
489 aa  290  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.41 
 
 
480 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  42.12 
 
 
484 aa  270  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  41.91 
 
 
478 aa  267  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  41.13 
 
 
488 aa  263  6e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  39.5 
 
 
468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  39.49 
 
 
440 aa  242  9e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3585  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.41 
 
 
484 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.08 
 
 
450 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  34.43 
 
 
482 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.1 
 
 
453 aa  209  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  35.86 
 
 
449 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0258  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.21 
 
 
539 aa  206  9e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  33.96 
 
 
481 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.78 
 
 
445 aa  200  6e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  33.88 
 
 
454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.61 
 
 
455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  34.24 
 
 
445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  33.18 
 
 
438 aa  196  6e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.49 
 
 
446 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.58 
 
 
436 aa  195  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.9 
 
 
456 aa  194  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.75 
 
 
452 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.93 
 
 
442 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  34.08 
 
 
435 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0056  porin (omp) ABC transporter protein  39.56 
 
 
460 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  34.08 
 
 
435 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  34.08 
 
 
435 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.84 
 
 
442 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.18 
 
 
477 aa  190  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  35.38 
 
 
434 aa  190  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.63 
 
 
479 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  34.41 
 
 
432 aa  189  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000929322  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  33.33 
 
 
442 aa  188  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  33.83 
 
 
435 aa  187  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.95 
 
 
477 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  32.48 
 
 
464 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  32.48 
 
 
464 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  35.1 
 
 
448 aa  186  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  34.37 
 
 
441 aa  186  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.06 
 
 
480 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  34.27 
 
 
435 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  34.27 
 
 
435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  34.27 
 
 
435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  34.27 
 
 
435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.68 
 
 
477 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  33.5 
 
 
435 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.68 
 
 
477 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  34.1 
 
 
443 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  33.25 
 
 
449 aa  183  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.78 
 
 
498 aa  183  8.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.25 
 
 
461 aa  182  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  34.02 
 
 
431 aa  182  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.39 
 
 
478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  32.56 
 
 
479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  33 
 
 
462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3077  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.76 
 
 
491 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.762548  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2180  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.83 
 
 
874 aa  180  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000461522  normal  0.954774 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  37.62 
 
 
432 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  33.1 
 
 
465 aa  179  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  30.84 
 
 
469 aa  179  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  31.67 
 
 
495 aa  179  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  31.67 
 
 
495 aa  179  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  31.67 
 
 
493 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  31.67 
 
 
493 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.67 
 
 
493 aa  178  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  31.43 
 
 
495 aa  178  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  31.67 
 
 
493 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  31.67 
 
 
493 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  31.43 
 
 
493 aa  177  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1282  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.59 
 
 
465 aa  176  9e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  31.19 
 
 
489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  30.96 
 
 
489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  30.96 
 
 
489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  30.96 
 
 
489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2830  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.63 
 
 
455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0538261  hitchhiker  0.00247347 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  30.96 
 
 
489 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  30.5 
 
 
470 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  31.99 
 
 
463 aa  173  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2682  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.75 
 
 
451 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.829421  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.33 
 
 
489 aa  169  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  30.61 
 
 
494 aa  169  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3453  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.72 
 
 
432 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  30.25 
 
 
441 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>