More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2283 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  100 
 
 		 480 aa  973    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  46.03 
 
 		 441 aa  359  7e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  46.46 
 
 		 468 aa  348  9e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  46.12 
 
 		 437 aa  341  1e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  40.65 
 
 		 497 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  39.5 
 
 		 512 aa  313  5.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.09 
 
 		 450 aa  309  6.999999999999999e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  43.09 
 
 		 434 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  40.5 
 
 		 453 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  40.09 
 
 		 493 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.88 
 
 		 442 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  40.47 
 
 		 469 aa  280  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  37.97 
 
 		 451 aa  278  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  39.23 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  40.34 
 
 		 491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  40.05 
 
 		 405 aa  274  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.62 
 
 		 489 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  37.36 
 
 		 478 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  39.01 
 
 		 447 aa  258  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  36.84 
 
 		 488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  38.43 
 
 		 440 aa  249  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  37.79 
 
 		 484 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2439  TolC family type I secretion outer membrane protein  41.64 
 
 		 443 aa  247  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.08 
 
 		 450 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.12 
 
 		 456 aa  230  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3585  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.92 
 
 		 484 aa  229  8e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.68 
 
 		 442 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.21 
 
 		 498 aa  224  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.68 
 
 		 461 aa  223  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.02 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.25 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  32.31 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000929322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.51 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  34.54 
 
 		 435 aa  216  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  34.37 
 
 		 435 aa  216  7e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  34.37 
 
 		 435 aa  216  7e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  34.37 
 
 		 435 aa  216  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0258  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.83 
 
 		 539 aa  215  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0736  hypothetical protein  32.74 
 
 		 455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  34.08 
 
 		 435 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  33.85 
 
 		 462 aa  213  5.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.88 
 
 		 481 aa  213  9e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  34.44 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  33.05 
 
 		 443 aa  212  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.56 
 
 		 446 aa  211  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0754  hypothetical protein  32.29 
 
 		 455 aa  210  6e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  34.24 
 
 		 431 aa  208  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  33.11 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  33.11 
 
 		 435 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  33.11 
 
 		 435 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  33.11 
 
 		 435 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.17 
 
 		 445 aa  204  4e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.33 
 
 		 449 aa  202  9e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  32.57 
 
 		 454 aa  201  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  34.33 
 
 		 432 aa  200  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  32.15 
 
 		 448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.39 
 
 		 494 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  31.93 
 
 		 449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  32.45 
 
 		 481 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  31.84 
 
 		 441 aa  196  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  32.41 
 
 		 477 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2905  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.85 
 
 		 455 aa  196  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2047  type I secretion outer membrane protein  31.25 
 
 		 616 aa  195  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.89 
 
 		 455 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0139  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.05 
 
 		 616 aa  194  4e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.33 
 
 		 446 aa  192  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1557  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.43 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2830  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.64 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0538261  hitchhiker  0.00247347 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  32.24 
 
 		 482 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  32.31 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.06 
 
 		 479 aa  191  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.33 
 
 		 453 aa  190  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  30.24 
 
 		 479 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  31.95 
 
 		 481 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2682  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.16 
 
 		 451 aa  189  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.829421  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  30.62 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.39 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  31.58 
 
 		 438 aa  189  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1282  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.64 
 
 		 465 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.09 
 
 		 446 aa  186  6e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.31 
 
 		 456 aa  186  9e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  31.07 
 
 		 442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3159  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.79 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.334096  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  31.43 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  31.87 
 
 		 493 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  28.96 
 
 		 470 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  32.22 
 
 		 493 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  32.22 
 
 		 493 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.22 
 
 		 493 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.21 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  32.22 
 
 		 493 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  32.22 
 
 		 495 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  32.22 
 
 		 493 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  32.22 
 
 		 495 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  29.56 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1726  secretion protein  33.65 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379002  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3328  ABC transporter, permease protein  30.75 
 
 		 456 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262756  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2109  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.05 
 
 		 466 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20050  putative outer membrane protein  33.65 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.7908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  30.41 
 
 		 494 aa  182  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>