More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1990 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  100 
 
 
498 aa  968    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  41.59 
 
 
481 aa  298  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.14 
 
 
468 aa  266  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  38.23 
 
 
437 aa  246  6.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  38.64 
 
 
484 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.22 
 
 
441 aa  225  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  38.22 
 
 
449 aa  222  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  36.41 
 
 
493 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.07 
 
 
461 aa  221  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.3 
 
 
480 aa  219  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  36.64 
 
 
478 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  37.86 
 
 
434 aa  212  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.6 
 
 
453 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.01 
 
 
445 aa  211  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3077  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.04 
 
 
491 aa  210  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.762548  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  36.17 
 
 
488 aa  210  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  33.11 
 
 
462 aa  209  9e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  36.56 
 
 
440 aa  206  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.95 
 
 
497 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  33.82 
 
 
442 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.03 
 
 
450 aa  204  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.79 
 
 
436 aa  203  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.07 
 
 
456 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.33 
 
 
494 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  33.02 
 
 
482 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.33 
 
 
450 aa  197  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.14 
 
 
480 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  32.3 
 
 
481 aa  193  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.91 
 
 
453 aa  192  9e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.09 
 
 
479 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  32.27 
 
 
445 aa  192  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  31.99 
 
 
438 aa  190  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.72 
 
 
477 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.72 
 
 
477 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.72 
 
 
477 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  32.6 
 
 
479 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.96 
 
 
512 aa  189  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  32.24 
 
 
470 aa  189  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.19 
 
 
469 aa  189  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.32 
 
 
477 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.87 
 
 
478 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.1 
 
 
405 aa  188  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  30.33 
 
 
449 aa  187  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.32 
 
 
446 aa  183  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.51 
 
 
446 aa  183  6e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.24 
 
 
489 aa  183  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.99 
 
 
491 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.38 
 
 
452 aa  182  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  31.48 
 
 
463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  31.15 
 
 
452 aa  181  4e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  30.21 
 
 
432 aa  180  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000929322  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.31 
 
 
442 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.25 
 
 
489 aa  177  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  30.93 
 
 
469 aa  177  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  31.25 
 
 
463 aa  177  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  29.31 
 
 
435 aa  176  8e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  31.97 
 
 
464 aa  176  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  31.97 
 
 
464 aa  176  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  29.31 
 
 
435 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  29.31 
 
 
435 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  31.55 
 
 
465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  31.33 
 
 
495 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  31.33 
 
 
493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  31.33 
 
 
495 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  34.86 
 
 
447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  31.33 
 
 
493 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.33 
 
 
493 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  30.26 
 
 
435 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  31.33 
 
 
493 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  31.33 
 
 
493 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  29.9 
 
 
443 aa  173  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.55 
 
 
464 aa  173  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  31.33 
 
 
493 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.99 
 
 
446 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  29.81 
 
 
435 aa  172  9e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.82 
 
 
449 aa  172  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  30.22 
 
 
497 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.62 
 
 
452 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.11 
 
 
442 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  30.5 
 
 
441 aa  172  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  31.08 
 
 
495 aa  171  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  29.22 
 
 
434 aa  170  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.37 
 
 
446 aa  170  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  30.21 
 
 
494 aa  169  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1145  anibiotic ABC transporter efflux pump  33.74 
 
 
442 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950506  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  28.5 
 
 
435 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  30.92 
 
 
444 aa  168  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  30.97 
 
 
448 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  28.5 
 
 
435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  30.34 
 
 
489 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  30.34 
 
 
489 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  30.89 
 
 
489 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  28.5 
 
 
435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  28.5 
 
 
435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  30.34 
 
 
489 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  30.34 
 
 
489 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.62 
 
 
442 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.81 
 
 
456 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1407  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.5 
 
 
451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.25 
 
 
452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>