More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_48090 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  92.31 
 
 
477 aa  875    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  100 
 
 
481 aa  976    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2682  Type I secretion outer membrane protein, TolC  53.76 
 
 
451 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.829421  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3159  Type I secretion outer membrane protein, TolC  50.45 
 
 
449 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.334096  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1726  secretion protein  52.46 
 
 
451 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379002  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3328  ABC transporter, permease protein  50.34 
 
 
456 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262756  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  48.56 
 
 
459 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20050  putative outer membrane protein  52.82 
 
 
451 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.7908  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1407  type I secretion outer membrane protein, TolC family  50.24 
 
 
451 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2109  type I secretion outer membrane protein, TolC family  46.17 
 
 
466 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1557  type I secretion outer membrane protein, TolC family  48.53 
 
 
455 aa  378  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2905  type I secretion outer membrane protein, TolC family  48.73 
 
 
455 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1282  Type I secretion outer membrane protein, TolC  40.09 
 
 
465 aa  333  5e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.05 
 
 
442 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.47 
 
 
442 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.47 
 
 
427 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.01 
 
 
452 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.02 
 
 
446 aa  208  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  34.88 
 
 
437 aa  207  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.85 
 
 
455 aa  201  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.33 
 
 
445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.45 
 
 
480 aa  194  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.53 
 
 
497 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  30.16 
 
 
484 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.66 
 
 
456 aa  186  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.31 
 
 
468 aa  184  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.93 
 
 
449 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.03 
 
 
446 aa  183  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.21 
 
 
434 aa  180  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  30.12 
 
 
493 aa  179  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.84 
 
 
478 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2203  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.67 
 
 
441 aa  178  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.917815  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.54 
 
 
441 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.12 
 
 
488 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.77 
 
 
489 aa  172  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.7 
 
 
450 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.73 
 
 
469 aa  168  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0754  hypothetical protein  26.68 
 
 
455 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  30.36 
 
 
440 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.19 
 
 
456 aa  167  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  29.45 
 
 
454 aa  167  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0682  Outer membrane protein-like  28 
 
 
443 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.111346  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0736  hypothetical protein  26.46 
 
 
455 aa  166  9e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  29.36 
 
 
462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  29.75 
 
 
438 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.57 
 
 
498 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.99 
 
 
436 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  28.77 
 
 
434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.85 
 
 
489 aa  163  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.49 
 
 
491 aa  163  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.03 
 
 
450 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  29.76 
 
 
435 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.93 
 
 
512 aa  162  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.02 
 
 
461 aa  160  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  30.4 
 
 
435 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  29.95 
 
 
448 aa  159  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.67 
 
 
453 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  29.62 
 
 
442 aa  157  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  29.31 
 
 
431 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  28.81 
 
 
435 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  28.81 
 
 
435 aa  156  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  28.81 
 
 
435 aa  156  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  29.69 
 
 
435 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  29.45 
 
 
435 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  29.45 
 
 
435 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.69 
 
 
442 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  29.45 
 
 
435 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  29.07 
 
 
445 aa  154  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  28.05 
 
 
443 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  29.93 
 
 
470 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  29.86 
 
 
432 aa  152  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000929322  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  29.64 
 
 
432 aa  150  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.35 
 
 
449 aa  150  7e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  28.37 
 
 
441 aa  149  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3585  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.68 
 
 
484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.88 
 
 
464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2439  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.12 
 
 
443 aa  146  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  30.45 
 
 
463 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  31.46 
 
 
451 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1145  anibiotic ABC transporter efflux pump  28.64 
 
 
442 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950506  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.87 
 
 
453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  27.85 
 
 
441 aa  141  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  26.11 
 
 
481 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.66 
 
 
405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  29.16 
 
 
463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  29.47 
 
 
497 aa  140  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  26.34 
 
 
482 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  27.13 
 
 
449 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.18 
 
 
477 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0258  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.62 
 
 
539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.7 
 
 
494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  28.1 
 
 
469 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2180  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.34 
 
 
874 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000461522  normal  0.954774 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  28.32 
 
 
489 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  28.32 
 
 
489 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  28.32 
 
 
489 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  28.32 
 
 
489 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.71 
 
 
480 aa  134  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  28.32 
 
 
489 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  27.85 
 
 
494 aa  133  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.203909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>