More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0258 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0258  TolC family type I secretion outer membrane protein  100 
 
 		 539 aa  1083    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0283  type I secretion outer membrane protein, TolC family  61.51 
 
 		 240 aa  333  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.421853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  39.96 
 
 		 493 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  39.78 
 
 		 497 aa  282  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  36.5 
 
 		 484 aa  249  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.59 
 
 		 453 aa  248  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  35.18 
 
 		 478 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  35.18 
 
 		 488 aa  243  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  36.34 
 
 		 512 aa  239  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.12 
 
 		 450 aa  238  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  36.69 
 
 		 434 aa  232  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.48 
 
 		 441 aa  228  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.1 
 
 		 469 aa  226  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3585  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.7 
 
 		 484 aa  213  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.55 
 
 		 468 aa  210  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  31.31 
 
 		 437 aa  207  5e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.22 
 
 		 405 aa  207  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.03 
 
 		 480 aa  207  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.55 
 
 		 442 aa  205  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.32 
 
 		 491 aa  202  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.64 
 
 		 489 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.38 
 
 		 446 aa  199  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  35.96 
 
 		 447 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  31.19 
 
 		 451 aa  194  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  31.5 
 
 		 440 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2439  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.16 
 
 		 443 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  29.28 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  30.56 
 
 		 482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  29.45 
 
 		 469 aa  173  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.26 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.7 
 
 		 461 aa  172  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  30.13 
 
 		 481 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.98 
 
 		 452 aa  171  4e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  30.07 
 
 		 452 aa  170  7e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0139  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.59 
 
 		 616 aa  170  8e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2047  type I secretion outer membrane protein  29.59 
 
 		 616 aa  169  9e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  28.57 
 
 		 449 aa  168  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  28.79 
 
 		 470 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.27 
 
 		 450 aa  167  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.05 
 
 		 455 aa  167  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.69 
 
 		 452 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.07 
 
 		 480 aa  163  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.07 
 
 		 436 aa  163  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.93 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  28.19 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  28.38 
 
 		 463 aa  162  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.36 
 
 		 442 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.82 
 
 		 449 aa  162  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  28.19 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.58 
 
 		 452 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.98 
 
 		 477 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.36 
 
 		 442 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  29.71 
 
 		 431 aa  160  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.41 
 
 		 478 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.71 
 
 		 477 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.27 
 
 		 456 aa  160  8e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0736  hypothetical protein  29.78 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  28.63 
 
 		 489 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  28.63 
 
 		 489 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  28.63 
 
 		 489 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  28.63 
 
 		 489 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.81 
 
 		 449 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  28.35 
 
 		 493 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  27.77 
 
 		 493 aa  156  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.41 
 
 		 479 aa  156  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  28.41 
 
 		 489 aa  156  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.87 
 
 		 453 aa  156  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  28.44 
 
 		 443 aa  156  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  27.55 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.55 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  27.85 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  28.51 
 
 		 443 aa  156  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  27.55 
 
 		 495 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  27.55 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  27.55 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  26.95 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  27.55 
 
 		 495 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  28.19 
 
 		 465 aa  156  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  28.01 
 
 		 479 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  29.69 
 
 		 441 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  27.48 
 
 		 462 aa  154  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  28.06 
 
 		 442 aa  154  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  27.33 
 
 		 495 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  28.57 
 
 		 435 aa  153  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  26.62 
 
 		 497 aa  153  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  28.57 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  28.17 
 
 		 494 aa  153  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0754  hypothetical protein  28.73 
 
 		 455 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  27.47 
 
 		 435 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  27.47 
 
 		 435 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.03 
 
 		 446 aa  150  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  27.25 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1277  outer membrane protein TolC, putative  27.79 
 
 		 479 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271455  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  27.48 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  27.84 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  27.56 
 
 		 448 aa  148  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.13 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3077  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.94 
 
 		 491 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.762548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  27.56 
 
 		 435 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  27.56 
 
 		 435 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>