More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0575 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  100 
 
 		 444 aa  899    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  100 
 
 		 444 aa  899    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0736  hypothetical protein  30.82 
 
 		 455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0754  hypothetical protein  30.82 
 
 		 455 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.88 
 
 		 453 aa  189  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.49 
 
 		 461 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.27 
 
 		 450 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.4 
 
 		 480 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.48 
 
 		 468 aa  178  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.32 
 
 		 441 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.05 
 
 		 436 aa  177  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  29.28 
 
 		 440 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.68 
 
 		 449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  33.56 
 
 		 437 aa  172  9e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.52 
 
 		 494 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  29.41 
 
 		 454 aa  170  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.14 
 
 		 477 aa  169  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  31.01 
 
 		 493 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.01 
 
 		 493 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  31.01 
 
 		 493 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  31.01 
 
 		 493 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  31.01 
 
 		 493 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  31.01 
 
 		 493 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  31.01 
 
 		 495 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  31.01 
 
 		 495 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.17 
 
 		 477 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.32 
 
 		 478 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.67 
 
 		 477 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  30.41 
 
 		 470 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.32 
 
 		 479 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.48 
 
 		 455 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  30.56 
 
 		 495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.73 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2203  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.45 
 
 		 441 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  28.23 
 
 		 479 aa  163  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  28.07 
 
 		 482 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  29.23 
 
 		 464 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  29.23 
 
 		 464 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  28.12 
 
 		 449 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  27.61 
 
 		 462 aa  160  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.31 
 
 		 498 aa  160  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.02 
 
 		 434 aa  159  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  27.69 
 
 		 484 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  29.89 
 
 		 465 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  29.78 
 
 		 489 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0139  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.01 
 
 		 616 aa  155  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  29.78 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  29.78 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  29.78 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2047  type I secretion outer membrane protein  28.01 
 
 		 616 aa  155  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  27.61 
 
 		 481 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.97 
 
 		 446 aa  155  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  29.78 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  29.84 
 
 		 469 aa  153  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3077  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.03 
 
 		 491 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.762548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  28.87 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  27.82 
 
 		 434 aa  152  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  28.79 
 
 		 494 aa  152  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  28.22 
 
 		 438 aa  151  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.83 
 
 		 489 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  28.41 
 
 		 435 aa  150  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  28.64 
 
 		 435 aa  150  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  29.98 
 
 		 432 aa  150  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000929322  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.11 
 
 		 442 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.57 
 
 		 452 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  27.57 
 
 		 435 aa  149  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  28.3 
 
 		 435 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  28.3 
 
 		 435 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  28.3 
 
 		 435 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  28.3 
 
 		 435 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  27.87 
 
 		 463 aa  149  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  27.19 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  28.4 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  27.59 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  27.93 
 
 		 497 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28 
 
 		 512 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.49 
 
 		 445 aa  146  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  27.4 
 
 		 441 aa  146  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.92 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  26.93 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.11 
 
 		 442 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.05 
 
 		 478 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  28.28 
 
 		 448 aa  142  9e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  27.44 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.05 
 
 		 488 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.67 
 
 		 456 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  26.35 
 
 		 452 aa  140  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.8 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.13 
 
 		 497 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.21 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  28.77 
 
 		 431 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  28.13 
 
 		 432 aa  137  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.1 
 
 		 481 aa  136  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  26.15 
 
 		 442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.49 
 
 		 442 aa  133  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.7 
 
 		 446 aa  133  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.7 
 
 		 453 aa  132  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.66 
 
 		 464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.22 
 
 		 491 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.22 
 
 		 489 aa  131  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>