More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0662 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0662  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 483 aa  967    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  31.56 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  32.02 
 
 		 461 aa  233  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1203  outer membrane efflux protein  31.32 
 
 		 497 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  30.08 
 
 		 443 aa  209  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0962  outer membrane efflux protein  28.21 
 
 		 464 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000066626  normal  0.118679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2866  outer membrane efflux protein  27.18 
 
 		 480 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0685652 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  27.87 
 
 		 444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1667  outer membrane efflux protein  25.45 
 
 		 455 aa  163  6e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  25.6 
 
 		 436 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  27.39 
 
 		 444 aa  146  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0679  outer membrane efflux protein  24.95 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0368289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4942  outer membrane efflux protein  25.57 
 
 		 449 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755187  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4897  outer membrane efflux protein  24.66 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861249  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  26.15 
 
 		 464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  21.41 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  21.56 
 
 		 471 aa  97.4  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.28 
 
 		 461 aa  97.1  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  22.22 
 
 		 500 aa  95.5  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.14 
 
 		 452 aa  93.2  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  21.35 
 
 		 470 aa  90.5  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1531  outer membrane efflux protein  25.51 
 
 		 472 aa  89.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0986  outer membrane efflux protein, putative  22.54 
 
 		 484 aa  89.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.84 
 
 		 452 aa  88.2  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.27 
 
 		 489 aa  87.8  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.72 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  25 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  24.16 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.02 
 
 		 455 aa  85.1  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  23.95 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  22.95 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  22.39 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  22.39 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23 
 
 		 497 aa  80.1  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  22.27 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.3 
 
 		 494 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  25.44 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  22.66 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  23.31 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.65 
 
 		 463 aa  76.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.1 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  18.88 
 
 		 463 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  25.83 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  23.63 
 
 		 482 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  21.03 
 
 		 469 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  19.74 
 
 		 483 aa  73.2  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.98 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.75 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  19.56 
 
 		 518 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  20 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.82 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.54 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  22.05 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  22.55 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.18 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.54 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2941  outer membrane efflux protein  26.1 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0140963  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.37 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.28 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  24.09 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  19.91 
 
 		 427 aa  69.7  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.93 
 
 		 464 aa  69.7  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  23.53 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  21.19 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  24.8 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.54 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  20.17 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  21.36 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  21.59 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  24.81 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  22.01 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  21.67 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.1 
 
 		 497 aa  67.8  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  24.08 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  21.78 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.01 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.01 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  24.54 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  20.98 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  21.99 
 
 		 493 aa  66.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  21.23 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.04 
 
 		 522 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.81 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  24.54 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  24.28 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  21.62 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  24.28 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  24.28 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  23.55 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.62 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  24.28 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  19.47 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0058  putative type I toxin secretion system, outer membrane efflux protein  24.5 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  17.9 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.67 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  21.01 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  26.67 
 
 		 425 aa  63.2  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.42 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.84 
 
 		 473 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  22.69 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>