More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1990 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 471 aa  961    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  29.52 
 
 		 453 aa  160  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  28.81 
 
 		 435 aa  150  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  27.17 
 
 		 421 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  28.84 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  27.39 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  27.44 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  27.53 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  28.53 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  26.73 
 
 		 431 aa  127  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  26.88 
 
 		 424 aa  127  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  27.14 
 
 		 461 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 420 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  26.19 
 
 		 482 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  25.8 
 
 		 441 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  25.35 
 
 		 470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  30.17 
 
 		 627 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  25.6 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  23.79 
 
 		 462 aa  110  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  22.54 
 
 		 463 aa  110  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.08 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  25.75 
 
 		 441 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  26.24 
 
 		 419 aa  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  26.36 
 
 		 443 aa  103  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 		 476 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  21.33 
 
 		 425 aa  103  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  22.55 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  27.08 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  25.24 
 
 		 446 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  26.48 
 
 		 491 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  22.57 
 
 		 515 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1525  outer membrane efflux protein  26.7 
 
 		 442 aa  100  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000580745  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  23.23 
 
 		 455 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  25.26 
 
 		 440 aa  97.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  21.28 
 
 		 458 aa  95.9  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 		 535 aa  94.4  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  22.92 
 
 		 463 aa  94  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 441 aa  93.6  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  22.53 
 
 		 463 aa  93.2  9e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 442 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  26.64 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  22.49 
 
 		 427 aa  90.9  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 972 aa  90.9  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  22.86 
 
 		 417 aa  89.4  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2298  outer membrane efflux protein  26.17 
 
 		 525 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 470 aa  89.7  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  23.92 
 
 		 437 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  25.23 
 
 		 731 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.41 
 
 		 460 aa  88.2  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  28.29 
 
 		 455 aa  87.8  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  24.15 
 
 		 500 aa  87.4  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  21.14 
 
 		 462 aa  85.9  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  23.41 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  24.13 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  27.98 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  23.66 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4294  outer membrane efflux protein  25.67 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190007  normal  0.396606 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  28.38 
 
 		 1496 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24.52 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.86 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  25.29 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  28 
 
 		 457 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  21.89 
 
 		 451 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  26.07 
 
 		 457 aa  82  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  24.44 
 
 		 576 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  18.76 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  23.8 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  26.33 
 
 		 497 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  23.64 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2362  outer membrane efflux protein  22.7 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  24.37 
 
 		 497 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  23.25 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  25.5 
 
 		 525 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  23.72 
 
 		 635 aa  80.1  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  23.23 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 452 aa  79.7  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  18.89 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3124  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  23.29 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  23.69 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 454 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1470 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  20.7 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  26.7 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  21.99 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.18 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  25.43 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  25.06 
 
 		 471 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  24.25 
 
 		 444 aa  72.8  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  25.38 
 
 		 454 aa  73.2  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.12 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>