284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2001 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  100 
 
 		 445 aa  908    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  60.04 
 
 		 441 aa  535  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  58.04 
 
 		 441 aa  521  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  58.43 
 
 		 440 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  57.79 
 
 		 413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  49.88 
 
 		 444 aa  381  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  44.84 
 
 		 441 aa  348  9e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  29.33 
 
 		 447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  27.91 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  26.39 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  24.71 
 
 		 443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  25.49 
 
 		 535 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  25.23 
 
 		 441 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  26.91 
 
 		 441 aa  107  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.61 
 
 		 460 aa  106  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  27.29 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  25.05 
 
 		 470 aa  103  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  24 
 
 		 515 aa  102  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 1496 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  25.58 
 
 		 446 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  25.97 
 
 		 483 aa  96.3  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  25.52 
 
 		 455 aa  94.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.75 
 
 		 1470 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  26.89 
 
 		 458 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  25.84 
 
 		 453 aa  91.3  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.41 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  26.84 
 
 		 473 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  26.84 
 
 		 473 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  25.76 
 
 		 437 aa  89  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 467 aa  89  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  23.85 
 
 		 463 aa  87.8  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 972 aa  87.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  26.6 
 
 		 448 aa  87.4  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  22.72 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  23.37 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  22.63 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  22.99 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  24.18 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  23.69 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0986  outer membrane efflux protein, putative  25.54 
 
 		 484 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  22 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  22.71 
 
 		 523 aa  74.3  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  27.9 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  22.99 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  23.94 
 
 		 491 aa  73.6  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  26.2 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  22.1 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  27.69 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  22.39 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  22.5 
 
 		 498 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  19.67 
 
 		 471 aa  70.5  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  20.91 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  23.97 
 
 		 488 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  25.95 
 
 		 463 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  25.95 
 
 		 456 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0617  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  24.27 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  21.84 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  22.69 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  22.08 
 
 		 443 aa  67  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  21.76 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  22.68 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  21.93 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 496 aa  64.7  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  22.37 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1924  Outer membrane protein  24.46 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0996265 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4294  outer membrane efflux protein  26.17 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190007  normal  0.396606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  22.83 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  21.53 
 
 		 469 aa  63.2  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  22.82 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  23.23 
 
 		 500 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  21.61 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  21.93 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  21.37 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  23.14 
 
 		 503 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  20.97 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  22.32 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  22.12 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  22.8 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  22.17 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  21.77 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2362  outer membrane efflux protein  22.96 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  22.12 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  19.91 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  21.8 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  22.27 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  21.34 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  22.27 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  22.27 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  20.99 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  21.82 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  22.49 
 
 		 489 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  22.27 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  21.73 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1211  hypothetical protein  20.32 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000512131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>