More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2704 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 423 aa  859    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  57.38 
 
 		 421 aa  462  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  56.26 
 
 		 421 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  56.51 
 
 		 435 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  55.77 
 
 		 426 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  47.51 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  47.65 
 
 		 424 aa  363  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  30 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  30.99 
 
 		 431 aa  146  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  27.53 
 
 		 471 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  30.28 
 
 		 419 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  28.27 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  27.36 
 
 		 491 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  31.35 
 
 		 453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  25.54 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  26.38 
 
 		 470 aa  113  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  27.82 
 
 		 441 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  26.1 
 
 		 447 aa  112  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  26.17 
 
 		 447 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  26.95 
 
 		 419 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  26.74 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  25.5 
 
 		 496 aa  104  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  26.44 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  25.29 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  22.82 
 
 		 417 aa  100  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  26.95 
 
 		 437 aa  97.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  26.3 
 
 		 470 aa  97.1  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 442 aa  96.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  28.85 
 
 		 439 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  28.03 
 
 		 449 aa  95.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  24.59 
 
 		 443 aa  94  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 483 aa  93.6  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3116  outer membrane efflux protein  25.71 
 
 		 465 aa  93.2  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  24.2 
 
 		 515 aa  92.8  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  24.13 
 
 		 463 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.6 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  22.6 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.47 
 
 		 479 aa  89.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.53 
 
 		 464 aa  89  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1525  outer membrane efflux protein  25.45 
 
 		 442 aa  88.6  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000580745  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  22.62 
 
 		 458 aa  88.2  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 462 aa  87.4  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  29.87 
 
 		 576 aa  86.7  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  23.46 
 
 		 437 aa  86.7  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.47 
 
 		 479 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.03 
 
 		 518 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.47 
 
 		 479 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.47 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.47 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.47 
 
 		 482 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.47 
 
 		 482 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.24 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1634  outer membrane efflux protein  23.41 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.194063  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  27.54 
 
 		 482 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  22.67 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.36 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  22.58 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  23.75 
 
 		 471 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  22.63 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  25.47 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3124  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  23.42 
 
 		 472 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  25.71 
 
 		 473 aa  79.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.86 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  25.71 
 
 		 473 aa  79.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  24.3 
 
 		 446 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  25.85 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  24.29 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  26.57 
 
 		 476 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.62 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  22.6 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  29.6 
 
 		 972 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 		 471 aa  76.6  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  23.96 
 
 		 485 aa  76.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 		 460 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  22.99 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  27.72 
 
 		 535 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  24.06 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.59 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.7 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  21.84 
 
 		 488 aa  73.2  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  23.79 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.72 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  24.5 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  22.71 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 498 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  22.71 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0685  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.01 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118649  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  24.22 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.51 
 
 		 497 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  30 
 
 		 627 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.51 
 
 		 488 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  25.2 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  25.24 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>