More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0283 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 439 aa  896    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  67.96 
 
 		 482 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  55.75 
 
 		 461 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  50.12 
 
 		 476 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  44.42 
 
 		 435 aa  356  5e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  42.76 
 
 		 453 aa  341  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  29.1 
 
 		 491 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  26.73 
 
 		 426 aa  111  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  23.94 
 
 		 483 aa  108  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  28.07 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  28.02 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 		 462 aa  100  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.8 
 
 		 441 aa  99  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  24.09 
 
 		 463 aa  96.7  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  28.85 
 
 		 423 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  26.89 
 
 		 436 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.36 
 
 		 470 aa  94  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  24 
 
 		 496 aa  94  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  25.84 
 
 		 421 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  27.96 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  25 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.69 
 
 		 471 aa  90.9  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 419 aa  90.5  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  28.12 
 
 		 419 aa  90.1  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  25.96 
 
 		 419 aa  90.1  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  26.01 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  26.17 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 		 431 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  25.86 
 
 		 440 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  23.67 
 
 		 431 aa  86.7  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 433 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.92 
 
 		 456 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  27.53 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  28.04 
 
 		 731 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  21.05 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  28.41 
 
 		 442 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  27.09 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  27.09 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  26.59 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  24.41 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.71 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  25.41 
 
 		 565 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.83 
 
 		 449 aa  83.2  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.52 
 
 		 1496 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  25.26 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4294  outer membrane efflux protein  25.82 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190007  normal  0.396606 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  26.1 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.29 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.92 
 
 		 1470 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  26.38 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  24.37 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  27.03 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  26.1 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.3 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  23.89 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.06 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.88 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  28.81 
 
 		 627 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.09 
 
 		 498 aa  77.4  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  23.02 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  25.06 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1577  outer membrane efflux protein, OprM  25.16 
 
 		 606 aa  77  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000543553  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  22.57 
 
 		 501 aa  76.6  0.0000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  22.28 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  24.62 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.56 
 
 		 518 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  26.38 
 
 		 576 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  23.52 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  27.58 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1759  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.32 
 
 		 600 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000901075  normal  0.0327712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  25.62 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  26.29 
 
 		 635 aa  74.7  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  23.82 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.17 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  24.33 
 
 		 525 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  24.59 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.58 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  23.3 
 
 		 477 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.39 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  23.56 
 
 		 497 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.67 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1822  putative outer membrane protein TolC  22.5 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  23.84 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 		 489 aa  71.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  21.92 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  23.88 
 
 		 499 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.1 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.67 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0574  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  25.39 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  25.48 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  25.26 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  23.97 
 
 		 470 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  22.94 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>