More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2001 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 473 aa  953    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 473 aa  953    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  41.59 
 
 		 515 aa  330  3e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  37.23 
 
 		 470 aa  302  8.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  24.03 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  28.96 
 
 		 446 aa  118  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  28.85 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  26.67 
 
 		 444 aa  100  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  27.15 
 
 		 435 aa  93.6  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0617  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 447 aa  93.6  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  22.7 
 
 		 463 aa  93.2  9e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  24.45 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  26.56 
 
 		 447 aa  89.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  26.84 
 
 		 445 aa  89  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  28.75 
 
 		 431 aa  88.2  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  26.59 
 
 		 447 aa  87.8  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  28.95 
 
 		 431 aa  87  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 458 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  25.29 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.24 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1037  RND efflux system, outer membrane protein  25.47 
 
 		 508 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1312  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  25.47 
 
 		 508 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2631  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  25.47 
 
 		 508 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0168  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  25.47 
 
 		 508 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618806  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  25.24 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0141  RND efflux system, outer membrane protein  25.47 
 
 		 506 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.75 
 
 		 501 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  22.89 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2774  Outer membrane protein  25.47 
 
 		 508 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  25.71 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  24.56 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  25.08 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  25.28 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  20.95 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  21.53 
 
 		 523 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0879  Outer membrane efflux protein  20.77 
 
 		 483 aa  76.6  0.0000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.175744  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  22.94 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  24.92 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.84 
 
 		 486 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0440  RND efflux system, outer membrane protein  25.74 
 
 		 509 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  26.36 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.23 
 
 		 500 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  27.2 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  28.33 
 
 		 470 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  21.04 
 
 		 467 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1690  outer membrane efflux protein  27.74 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  29.43 
 
 		 444 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  22.27 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.77 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  21.1 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  23.84 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.39 
 
 		 505 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  23.39 
 
 		 481 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  23.08 
 
 		 477 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  24.94 
 
 		 491 aa  70.1  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6609  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.78 
 
 		 510 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64888  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.89 
 
 		 494 aa  69.7  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2447  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.4 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1638  30S ribosomal protein S12  21.93 
 
 		 460 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0060  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.4 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0428433  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  27.2 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.33 
 
 		 507 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0381  outer membrane efflux protein OprB  26.4 
 
 		 553 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0317  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.4 
 
 		 514 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.34053  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1046  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.4 
 
 		 512 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0033  outer membrane efflux protein OprB  26.4 
 
 		 512 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.11 
 
 		 499 aa  68.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1203  outer membrane efflux protein OprB  26.4 
 
 		 512 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.21076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0612  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.4 
 
 		 514 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  26.04 
 
 		 488 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  21.43 
 
 		 496 aa  67.4  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  22.88 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  20.56 
 
 		 436 aa  67  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  24.16 
 
 		 535 aa  66.6  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  19.22 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 		 498 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  24.1 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  21.45 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  26.44 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.13 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1582  outer membrane efflux protein OprB  25.67 
 
 		 512 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1020  outer membrane efflux protein  25.67 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.224609  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0080  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.67 
 
 		 551 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0861  outer membrane efflux protein OprB  25.67 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.89354  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1499  outer membrane efflux protein OprB  25.67 
 
 		 512 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112473  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.93 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.7 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0856  outer membrane efflux protein OprB  25.67 
 
 		 514 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  28.66 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  24.1 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1407  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.34 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  24.7 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4902  outer membrane efflux protein  22.29 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  20.46 
 
 		 476 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0682  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.48 
 
 		 519 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>