More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1162 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 515 aa  1044    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  41.59 
 
 		 473 aa  330  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  41.59 
 
 		 473 aa  330  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  37.44 
 
 		 470 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  24.28 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0617  outer membrane efflux protein  26.54 
 
 		 447 aa  114  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  25.39 
 
 		 458 aa  114  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  29.36 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 447 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  29.36 
 
 		 431 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  25.28 
 
 		 446 aa  106  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  24 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  22.57 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 441 aa  100  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  26.22 
 
 		 426 aa  97.1  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 435 aa  97.1  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  24.12 
 
 		 453 aa  92.8  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  24.2 
 
 		 423 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 		 463 aa  91.7  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  24.12 
 
 		 437 aa  91.3  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  21.35 
 
 		 441 aa  90.9  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  22.81 
 
 		 441 aa  89.4  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 441 aa  88.2  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 444 aa  87.8  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  22.96 
 
 		 448 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  22.45 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0879  Outer membrane efflux protein  22.41 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.175744  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  19.91 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1690  outer membrane efflux protein  25.45 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  22.8 
 
 		 498 aa  80.5  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  24.01 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  27.38 
 
 		 525 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  25.77 
 
 		 488 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  25.42 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  22.87 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  22.28 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  24.16 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.82 
 
 		 497 aa  76.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.67 
 
 		 464 aa  76.6  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  20.99 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.01 
 
 		 489 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  22.49 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  23.72 
 
 		 457 aa  72  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  20.12 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  23.01 
 
 		 424 aa  72  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.03 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  21.71 
 
 		 535 aa  71.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  23.09 
 
 		 635 aa  70.9  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.94 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  22.58 
 
 		 491 aa  70.9  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  22.58 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  20.96 
 
 		 496 aa  69.3  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.73 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.46 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.67 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0141  RND efflux system, outer membrane protein  23.91 
 
 		 506 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1037  RND efflux system, outer membrane protein  23.91 
 
 		 508 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1312  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  23.91 
 
 		 508 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0168  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  23.91 
 
 		 508 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618806  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  22.37 
 
 		 477 aa  66.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2631  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  23.91 
 
 		 508 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.98 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.18 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  21.09 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.65 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  25.08 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  21.74 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  22.32 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.84 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2774  Outer membrane protein  23.67 
 
 		 508 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  26.15 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  23.04 
 
 		 465 aa  63.5  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  23.3 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  21.74 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0785  Outer membrane efflux protein  23.19 
 
 		 453 aa  63.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  20.86 
 
 		 427 aa  63.2  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  21.82 
 
 		 436 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  19.65 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  20.25 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0761  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.16 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  19.78 
 
 		 483 aa  62.4  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  21.14 
 
 		 491 aa  62  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.81 
 
 		 452 aa  62  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  23.58 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  22.41 
 
 		 578 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  22.41 
 
 		 578 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0620  outer membrane efflux protein  20.37 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000193694  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.52 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  19.87 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  22.25 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.44 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.34 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>