148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0617 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0617  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 447 aa  918    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0879  Outer membrane efflux protein  38.1 
 
 		 483 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.175744  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  26.54 
 
 		 515 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 473 aa  93.6  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 473 aa  93.6  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  26.16 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  25.87 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  22.41 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  23.87 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  25.19 
 
 		 435 aa  69.7  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  23.75 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  27.79 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 463 aa  66.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  22.71 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  22.46 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  24.16 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  27.35 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  26.62 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  22.34 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  20.32 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  22.65 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  22.16 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  25.43 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01590  putative outer membrane protein TolC  23.29 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29548  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  24.63 
 
 		 501 aa  57  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1442  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  20.82 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  24.57 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  22.19 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  20 
 
 		 449 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  23.91 
 
 		 437 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2659  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.21 
 
 		 451 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3811  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.93 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.521708  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.78 
 
 		 477 aa  55.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000572805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  19.83 
 
 		 441 aa  53.9  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  25.38 
 
 		 463 aa  53.9  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  23.25 
 
 		 523 aa  53.5  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  23.12 
 
 		 425 aa  53.5  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.78 
 
 		 633 aa  53.1  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  23.2 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0387  Fis family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0321  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.21 
 
 		 480 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  21.71 
 
 		 496 aa  51.6  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  25.21 
 
 		 497 aa  51.2  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  20.62 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0316  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.21 
 
 		 481 aa  50.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.464824  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.59 
 
 		 446 aa  50.4  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  29.59 
 
 		 445 aa  50.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.51 
 
 		 636 aa  50.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01131  RND family outer membrane efflux protein  22.69 
 
 		 475 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245379  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.98 
 
 		 457 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0171  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.83 
 
 		 490 aa  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  21.37 
 
 		 467 aa  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  23.83 
 
 		 470 aa  50.1  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  22.48 
 
 		 481 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  24.68 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1880  outer membrane protein  22.5 
 
 		 492 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 		 438 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0134  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25 
 
 		 450 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.37 
 
 		 609 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.95 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25 
 
 		 489 aa  48.9  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.38 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25 
 
 		 546 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16116  normal  0.32958 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  24.11 
 
 		 574 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.36 
 
 		 456 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.19 
 
 		 481 aa  48.5  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 525 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  24.81 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 		 497 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  23.81 
 
 		 574 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  22.3 
 
 		 447 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  21.74 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  22.46 
 
 		 443 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.13 
 
 		 471 aa  47.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6346  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.26 
 
 		 491 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  21.97 
 
 		 447 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.63 
 
 		 494 aa  47.4  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3605  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.98 
 
 		 502 aa  47.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00599235  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28780  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.57 
 
 		 512 aa  47  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506262  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.56 
 
 		 475 aa  47  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2832  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21 
 
 		 520 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  23.04 
 
 		 451 aa  47  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.38 
 
 		 450 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2335  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.47 
 
 		 471 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1407  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.84 
 
 		 451 aa  47  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 436 aa  47  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.47 
 
 		 471 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0491334  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2158  outer membrane efflux protein  24.24 
 
 		 467 aa  47  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00293127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  21.84 
 
 		 471 aa  46.6  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.64 
 
 		 450 aa  46.6  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2509  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.47 
 
 		 471 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  23.3 
 
 		 448 aa  46.6  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 457 aa  46.6  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2560  outer membrane efflux protein  21.8 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.27 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>