More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1880 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1880  outer membrane protein  100 
 
 		 492 aa  987    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  59.59 
 
 		 633 aa  570  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  46.69 
 
 		 636 aa  396  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  44.67 
 
 		 607 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  44.29 
 
 		 609 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  45.3 
 
 		 658 aa  360  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1664  type I secretion outer membrane protein, TolC family  42.46 
 
 		 466 aa  347  3e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.623373  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  43.58 
 
 		 484 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  41.06 
 
 		 471 aa  333  6e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0633  type I secretion outer membrane protein, TolC family  41.36 
 
 		 484 aa  332  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458641  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0784  type I secretion outer membrane protein, TolC family  40.42 
 
 		 491 aa  323  5e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.649029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  40.48 
 
 		 472 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2659  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.53 
 
 		 451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.74 
 
 		 445 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.51 
 
 		 471 aa  205  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.31 
 
 		 452 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.58 
 
 		 472 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.58 
 
 		 472 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  31.38 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.69 
 
 		 468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.41 
 
 		 473 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.41 
 
 		 473 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  30.41 
 
 		 436 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.5 
 
 		 450 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.56 
 
 		 457 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.3 
 
 		 475 aa  196  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  31.4 
 
 		 469 aa  196  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.98 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.98 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0134  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.66 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  29.78 
 
 		 436 aa  196  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  30.99 
 
 		 437 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.63 
 
 		 470 aa  195  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.32 
 
 		 501 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  30.93 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.5 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.47 
 
 		 471 aa  194  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.66 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  34 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  29.18 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.25 
 
 		 471 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.25 
 
 		 471 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.04 
 
 		 472 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.72 
 
 		 470 aa  188  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  30.97 
 
 		 469 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  29.68 
 
 		 423 aa  187  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.94 
 
 		 457 aa  186  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.94 
 
 		 456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1293  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  32.75 
 
 		 430 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  29.9 
 
 		 425 aa  184  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.26 
 
 		 442 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0204  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.28 
 
 		 441 aa  180  4.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  28.02 
 
 		 574 aa  167  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  27.69 
 
 		 574 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.9 
 
 		 431 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.35 
 
 		 450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.39 
 
 		 450 aa  148  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0790  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.06 
 
 		 440 aa  146  8.000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000109355  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0010  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.86 
 
 		 443 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444301  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1978  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.83 
 
 		 456 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.19 
 
 		 475 aa  136  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0160  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.75 
 
 		 566 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.213741  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0888  ComEC/Rec2 family protein  26.11 
 
 		 559 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289662  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0634  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.58 
 
 		 467 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000541353  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1875  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.67 
 
 		 476 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.95 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.91 
 
 		 444 aa  128  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.6 
 
 		 519 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.68 
 
 		 524 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  26.6 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.52 
 
 		 522 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.13 
 
 		 487 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.36 
 
 		 455 aa  97.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.6 
 
 		 456 aa  97.1  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.94 
 
 		 464 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  27.31 
 
 		 452 aa  95.5  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  27.08 
 
 		 456 aa  94.4  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.74 
 
 		 483 aa  93.6  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.94 
 
 		 460 aa  93.2  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.11 
 
 		 463 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  25.38 
 
 		 490 aa  91.7  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.67 
 
 		 494 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.28 
 
 		 518 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.85 
 
 		 464 aa  86.7  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.84 
 
 		 497 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.76 
 
 		 489 aa  84.7  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  26.76 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  26.73 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.19 
 
 		 497 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.19 
 
 		 488 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.6 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0736  hypothetical protein  20.51 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.97 
 
 		 463 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0754  hypothetical protein  20.51 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.11 
 
 		 472 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0829  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.04 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.461433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0805  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.04 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.39 
 
 		 472 aa  77  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.15 
 
 		 497 aa  76.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40250  putative outer membrane protein precursor  26.81 
 
 		 425 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311034  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>