More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0321 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0321  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
480 aa  960    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0387  Fis family transcriptional regulator  78.95 
 
 
492 aa  675    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0316  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  94.39 
 
 
481 aa  851    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.464824  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  67.61 
 
 
485 aa  597  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  65.28 
 
 
495 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  64.52 
 
 
489 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4833  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  65.5 
 
 
474 aa  558  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.820871  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  63.76 
 
 
499 aa  553  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2254  RND efflux system outer membrane lipoprotein  66.89 
 
 
487 aa  541  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  50.3 
 
 
505 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  53.86 
 
 
485 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  53.86 
 
 
485 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6609  RND efflux system outer membrane lipoprotein  52.02 
 
 
510 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64888  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  46.21 
 
 
525 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0710  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.32 
 
 
515 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437206  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  51.77 
 
 
489 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  49.6 
 
 
507 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  50.86 
 
 
474 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  50.75 
 
 
470 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0506  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  53.19 
 
 
492 aa  439  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2527  RND efflux system outer membrane lipoprotein  50.6 
 
 
507 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2654  RND efflux system outer membrane lipoprotein  50.6 
 
 
507 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354944  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  49.6 
 
 
507 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2607  RND efflux system outer membrane lipoprotein  49.6 
 
 
507 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  50.64 
 
 
486 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  50.96 
 
 
474 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0690  RND efflux system outer membrane lipoprotein  50.1 
 
 
507 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1997  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  49.6 
 
 
507 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0794932  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4305  outer membrane efflux protein  50.75 
 
 
486 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6682  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.59 
 
 
508 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229467  normal  0.0582449 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6206  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.38 
 
 
508 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00238233 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  51.31 
 
 
499 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000707781  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5839  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  51.38 
 
 
508 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530876  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1203  outer membrane efflux protein OprB  51.38 
 
 
512 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.21076  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0033  outer membrane efflux protein OprB  51.38 
 
 
512 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0317  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.38 
 
 
514 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.34053  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1046  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.38 
 
 
512 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1416  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  52.46 
 
 
469 aa  429  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0080  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.38 
 
 
551 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.08 
 
 
482 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0612  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.38 
 
 
514 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.73 
 
 
503 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1582  outer membrane efflux protein OprB  51.38 
 
 
512 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0381  outer membrane efflux protein OprB  51.38 
 
 
553 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0861  outer membrane efflux protein OprB  51.38 
 
 
514 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.89354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1020  outer membrane efflux protein  51.38 
 
 
514 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.224609  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2447  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.17 
 
 
514 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  49.58 
 
 
499 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0060  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.17 
 
 
514 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0428433  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1286  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.59 
 
 
543 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556611  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0682  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.59 
 
 
519 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323921  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  50.86 
 
 
514 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1499  outer membrane efflux protein OprB  51.17 
 
 
512 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112473  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0856  outer membrane efflux protein OprB  51.38 
 
 
514 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3433  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  50 
 
 
477 aa  428  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  50.86 
 
 
514 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2695  outer membrane efflux protein  49.68 
 
 
512 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3442  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  49.26 
 
 
496 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.811835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  52.67 
 
 
486 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  49.68 
 
 
484 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  50 
 
 
477 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  48.53 
 
 
517 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  49.89 
 
 
500 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0532  RND efflux system outer membrane lipoprotein  49.16 
 
 
475 aa  413  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.17075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1337  RND efflux system outer membrane lipoprotein  49.04 
 
 
471 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  50.64 
 
 
478 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  50 
 
 
474 aa  411  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  49.89 
 
 
470 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  51.31 
 
 
472 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3590  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  49.89 
 
 
491 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  47.74 
 
 
484 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  49.24 
 
 
514 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1154  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  50 
 
 
501 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.039626  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6465  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.29 
 
 
475 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0283455 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5965  RND efflux system outer membrane lipoprotein  48.29 
 
 
475 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5601  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  48.29 
 
 
475 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.74 
 
 
484 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  50.22 
 
 
491 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.53 
 
 
484 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  47.29 
 
 
474 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5237  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  47.27 
 
 
516 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776503  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  49.89 
 
 
501 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3678  outer membrane efflux protein  48.69 
 
 
469 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0849669  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.79 
 
 
472 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4027  RND efflux system outer membrane lipoprotein  49.46 
 
 
467 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.296212  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0443  outer membrane efflux protein OprA  47.02 
 
 
485 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.340499  hitchhiker  0.0000000156404 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2963  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  51.64 
 
 
487 aa  395  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1737  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  46.25 
 
 
497 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746142  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0383  outer membrane protein OprM  47.02 
 
 
485 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0381  outer membrane protein OprM  46.82 
 
 
485 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119096 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0403  outer membrane protein OprM  47.66 
 
 
485 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102824 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  49.12 
 
 
483 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0775  RND efflux system outer membrane lipoprotein  47.55 
 
 
476 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0389  outer membrane protein OprM  46.5 
 
 
485 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.303382  hitchhiker  0.0000297498 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0121  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  46.67 
 
 
469 aa  383  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6990  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  47.08 
 
 
479 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0598431  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2838  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.2 
 
 
528 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.207275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3271  outer membrane efflux protein OprA  46.55 
 
 
467 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.04 
 
 
495 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2327  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.33 
 
 
528 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.356993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>