More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1440 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 503 aa  1039    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  49.89 
 
 		 488 aa  479  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4130  outer membrane efflux protein  44.07 
 
 		 516 aa  409  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2298  outer membrane efflux protein  39.88 
 
 		 525 aa  333  5e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  24.28 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  26.98 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  23.9 
 
 		 467 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 		 464 aa  97.8  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 419 aa  97.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0785  Outer membrane efflux protein  24.03 
 
 		 453 aa  96.3  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  24.74 
 
 		 489 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.9 
 
 		 441 aa  95.9  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  21.89 
 
 		 463 aa  95.5  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  23.9 
 
 		 473 aa  95.9  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  24.74 
 
 		 489 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  24.74 
 
 		 489 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 473 aa  93.6  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  24.23 
 
 		 473 aa  93.2  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 493 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 489 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  25.13 
 
 		 489 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  22.49 
 
 		 458 aa  92  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  23.87 
 
 		 496 aa  92  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 477 aa  91.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  25.26 
 
 		 467 aa  90.9  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  22.68 
 
 		 471 aa  90.9  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  22.68 
 
 		 462 aa  90.5  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1211  hypothetical protein  22.07 
 
 		 476 aa  88.6  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000512131  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  22.65 
 
 		 463 aa  88.2  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.52 
 
 		 463 aa  88.6  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 		 419 aa  87.4  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 471 aa  87  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  23.09 
 
 		 435 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0814  outer membrane efflux protein, putative  24.93 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3184  outer membrane efflux protein  24.27 
 
 		 460 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0733975  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  22.71 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  21.89 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1839  outer membrane efflux protein  21.78 
 
 		 466 aa  83.2  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  21.51 
 
 		 470 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  22.22 
 
 		 463 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  24.1 
 
 		 1496 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  21.72 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  21.7 
 
 		 463 aa  77.4  0.0000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  24.04 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  20.24 
 
 		 473 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1042  outer membrane efflux protein  22.34 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  20.16 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.18 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  23.78 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  22.51 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  22.77 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1897  putative Outer membrane protein  23.61 
 
 		 453 aa  73.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  23.49 
 
 		 419 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  22.01 
 
 		 501 aa  72.4  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  25.23 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  24.79 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  21.9 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0478  outer membrane efflux protein  20.12 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  23.13 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  19.35 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  20.95 
 
 		 471 aa  69.7  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  24.13 
 
 		 431 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  21.8 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  20.97 
 
 		 455 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  21.09 
 
 		 470 aa  68.6  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.13 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  21.1 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  27.37 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  27.13 
 
 		 462 aa  67  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0617  outer membrane efflux protein  26.62 
 
 		 447 aa  67  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  20.53 
 
 		 461 aa  67  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  23.14 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  22.09 
 
 		 460 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  22.47 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2597  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.28 
 
 		 492 aa  65.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  22.48 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  21.85 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  19.87 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0879  Outer membrane efflux protein  23.66 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.175744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  22.09 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  21.05 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  21.59 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2692  outer membrane efflux protein  24.04 
 
 		 469 aa  63.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  27.43 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.75 
 
 		 546 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16116  normal  0.32958 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 		 515 aa  62.8  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.85 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  27.43 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  22.1 
 
 		 449 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.55 
 
 		 553 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  27.43 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  22.61 
 
 		 1470 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  22.04 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>