247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0605 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  100 
 
 
470 aa  962    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  26.55 
 
 
452 aa  178  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1211  hypothetical protein  30.75 
 
 
476 aa  177  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000512131  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  28.6 
 
 
471 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  27.43 
 
 
473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 
465 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  26.98 
 
 
467 aa  163  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  27.84 
 
 
463 aa  162  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  26.35 
 
 
464 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  28.08 
 
 
473 aa  157  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  30.43 
 
 
457 aa  156  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  27.84 
 
 
489 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  26.49 
 
 
517 aa  155  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  27.84 
 
 
489 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  27.68 
 
 
489 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  26.28 
 
 
463 aa  150  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  26.73 
 
 
489 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  26.73 
 
 
489 aa  150  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  26.73 
 
 
473 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  26.73 
 
 
493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  26.22 
 
 
473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1839  outer membrane efflux protein  28.8 
 
 
466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  25.54 
 
 
477 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4572  outer membrane efflux protein  28.67 
 
 
483 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345417  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0478  outer membrane efflux protein  25.69 
 
 
471 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1040  outer membrane efflux protein  27.52 
 
 
583 aa  124  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  22.48 
 
 
458 aa  117  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0654  outer membrane efflux protein  25.23 
 
 
587 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  23.22 
 
 
449 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 
471 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  20.99 
 
 
451 aa  87  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  22.19 
 
 
491 aa  86.7  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1924  Outer membrane protein  22.49 
 
 
494 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0996265 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  21.9 
 
 
448 aa  84.7  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  22.08 
 
 
425 aa  82  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 
431 aa  80.1  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  21.52 
 
 
463 aa  80.1  0.00000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  26.95 
 
 
447 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  23.46 
 
 
459 aa  77  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01590  putative outer membrane protein TolC  24.13 
 
 
451 aa  77  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  24.31 
 
 
447 aa  77  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  23.98 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  22.55 
 
 
462 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  24.21 
 
 
453 aa  75.5  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  23.64 
 
 
431 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  22.34 
 
 
501 aa  73.9  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  23.64 
 
 
1496 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  19.87 
 
 
488 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.68 
 
 
455 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  23.34 
 
 
455 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  24.67 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  22.05 
 
 
460 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  21.09 
 
 
441 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 
427 aa  69.7  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  20.71 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  21.94 
 
 
467 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  22.61 
 
 
417 aa  66.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  27.31 
 
 
438 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 
444 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2340  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.75 
 
 
502 aa  64.3  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  20.68 
 
 
462 aa  63.9  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  20.94 
 
 
455 aa  63.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  21.09 
 
 
503 aa  63.9  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  22.55 
 
 
442 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1155  MFS efflux system, outer membrane porin  23.45 
 
 
511 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159689  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  22.41 
 
 
738 aa  62.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.81 
 
 
481 aa  63.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2180  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.23 
 
 
874 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000461522  normal  0.954774 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  22.6 
 
 
463 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.1 
 
 
511 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  20.95 
 
 
471 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0617  outer membrane efflux protein  22.46 
 
 
447 aa  62.4  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  23.14 
 
 
446 aa  62.4  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 
455 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  21.21 
 
 
441 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  21.31 
 
 
444 aa  60.1  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  20.35 
 
 
470 aa  60.1  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  20.8 
 
 
444 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3110  outer membrane efflux protein  22.94 
 
 
443 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  21.99 
 
 
448 aa  59.3  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4284  Outer membrane protein-like protein  21.04 
 
 
480 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  20.89 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  24.31 
 
 
463 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1186  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 
480 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.132692  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  24.31 
 
 
456 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  22.41 
 
 
421 aa  58.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 
458 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.63 
 
 
456 aa  58.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  25 
 
 
495 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  21.59 
 
 
496 aa  57  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  22.69 
 
 
441 aa  57  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 
495 aa  57  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  22.83 
 
 
461 aa  57  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  26.67 
 
 
458 aa  57  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  25.6 
 
 
454 aa  57  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  25.09 
 
 
484 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  25.56 
 
 
443 aa  55.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0144  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.03 
 
 
483 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.16245  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1477  outer membrane efflux protein  25.51 
 
 
454 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.94 
 
 
453 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>