More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0134 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0134  Type I secretion outer membrane protein, TolC  100 
 
 		 450 aa  920    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  80.44 
 
 		 445 aa  756    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  59.65 
 
 		 450 aa  542  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  59.42 
 
 		 450 aa  540  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  58.65 
 
 		 451 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  53.11 
 
 		 457 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  53.35 
 
 		 452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  53.35 
 
 		 452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  52.66 
 
 		 452 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  52.47 
 
 		 452 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  39.19 
 
 		 470 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.12 
 
 		 470 aa  299  6e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.22 
 
 		 475 aa  299  7e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.17 
 
 		 472 aa  298  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.98 
 
 		 471 aa  295  8e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  38.43 
 
 		 471 aa  293  5e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.67 
 
 		 471 aa  292  7e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.36 
 
 		 471 aa  292  7e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.36 
 
 		 471 aa  292  7e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.17 
 
 		 472 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.3 
 
 		 468 aa  291  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  41.44 
 
 		 457 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.95 
 
 		 472 aa  289  7e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  37.71 
 
 		 436 aa  288  9e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.72 
 
 		 456 aa  289  9e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  37.56 
 
 		 469 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  37.71 
 
 		 436 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  37.24 
 
 		 469 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.73 
 
 		 473 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  36.73 
 
 		 473 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  35.75 
 
 		 437 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1293  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  38.23 
 
 		 430 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  36.77 
 
 		 445 aa  273  5.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  36.47 
 
 		 440 aa  272  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  37.44 
 
 		 425 aa  271  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  39.07 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  36.96 
 
 		 423 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.44 
 
 		 501 aa  260  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0204  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.71 
 
 		 441 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  33.8 
 
 		 574 aa  245  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  33.56 
 
 		 574 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.65 
 
 		 431 aa  234  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1664  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.89 
 
 		 466 aa  220  5e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.623373  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.53 
 
 		 607 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0790  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.78 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000109355  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.52 
 
 		 484 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.33 
 
 		 471 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.55 
 
 		 609 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0784  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.52 
 
 		 491 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.649029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.43 
 
 		 636 aa  213  7.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.33 
 
 		 450 aa  212  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.42 
 
 		 633 aa  212  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0633  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.3 
 
 		 484 aa  211  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458641  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.3 
 
 		 472 aa  211  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.57 
 
 		 658 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1880  outer membrane protein  33.66 
 
 		 492 aa  199  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.04 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.93 
 
 		 472 aa  195  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1978  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.72 
 
 		 456 aa  189  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2659  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.32 
 
 		 451 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.78 
 
 		 444 aa  177  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0010  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.43 
 
 		 443 aa  164  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444301  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1875  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.74 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0160  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.3 
 
 		 566 aa  159  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.213741  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.14 
 
 		 475 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0888  ComEC/Rec2 family protein  28.04 
 
 		 559 aa  157  4e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289662  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.88 
 
 		 524 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0634  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.79 
 
 		 467 aa  143  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000541353  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.78 
 
 		 519 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.71 
 
 		 464 aa  129  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.74 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40250  putative outer membrane protein precursor  26.84 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3411  hypothetical protein  26.84 
 
 		 425 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  24.43 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.62 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.72 
 
 		 488 aa  106  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.72 
 
 		 497 aa  106  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.16 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.12 
 
 		 518 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.02 
 
 		 487 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.25 
 
 		 488 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.46 
 
 		 522 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  24.62 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  24.01 
 
 		 461 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  22.82 
 
 		 490 aa  94.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.82 
 
 		 483 aa  94  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0054  outer membrane efflux protein  26.56 
 
 		 520 aa  94  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.906913  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.88 
 
 		 472 aa  94  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.06 
 
 		 538 aa  92.8  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.37 
 
 		 464 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.24 
 
 		 472 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.33 
 
 		 463 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.05 
 
 		 553 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1000  outer membrane efflux protein  27.43 
 
 		 440 aa  91.3  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.148776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0823  Outer membrane efflux protein  22.49 
 
 		 432 aa  90.9  4e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0383439  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.18 
 
 		 442 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  21.73 
 
 		 438 aa  87.8  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  22.11 
 
 		 469 aa  87.4  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.65 
 
 		 452 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.41 
 
 		 442 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.262509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>