More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1749 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 458 aa  937    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  35.33 
 
 		 463 aa  243  6e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  28.15 
 
 		 458 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  27.83 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  24.04 
 
 		 447 aa  130  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 470 aa  129  9.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  25.28 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  23.14 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 		 448 aa  123  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  25.45 
 
 		 437 aa  123  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 515 aa  119  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  24.03 
 
 		 473 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  24.03 
 
 		 473 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  22.48 
 
 		 470 aa  117  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  26.39 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  25.44 
 
 		 441 aa  110  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 		 440 aa  109  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  25.69 
 
 		 441 aa  107  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  22.77 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  23.48 
 
 		 449 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  27.35 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  22.09 
 
 		 431 aa  103  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  22.57 
 
 		 1470 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  22.57 
 
 		 491 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  22.73 
 
 		 1496 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  23.46 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  23.59 
 
 		 435 aa  97.8  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  21.79 
 
 		 471 aa  97.8  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  24.43 
 
 		 433 aa  96.3  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  21.85 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  21.28 
 
 		 471 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  22.51 
 
 		 452 aa  95.5  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  21.73 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  22.99 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 446 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  22.02 
 
 		 435 aa  94.4  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  21.91 
 
 		 463 aa  94.4  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  24.11 
 
 		 437 aa  94  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  24.14 
 
 		 438 aa  93.2  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  21.2 
 
 		 457 aa  90.9  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 		 435 aa  90.1  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 		 408 aa  90.1  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  21.66 
 
 		 455 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  19.82 
 
 		 441 aa  87.8  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  22.02 
 
 		 455 aa  87.4  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  22.52 
 
 		 460 aa  87.4  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  22.27 
 
 		 443 aa  87  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  23.65 
 
 		 565 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  20.57 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  22.49 
 
 		 503 aa  83.2  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1211  hypothetical protein  19.42 
 
 		 476 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000512131  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  25.4 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  20.66 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  24.67 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  24.55 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  20.61 
 
 		 500 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1773  outer membrane efflux protein  25.22 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  21.62 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4902  outer membrane efflux protein  24.43 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  21.03 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  20.67 
 
 		 464 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  23.15 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  20.92 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  19.87 
 
 		 525 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  22.01 
 
 		 535 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  19.27 
 
 		 498 aa  77.8  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  22.92 
 
 		 488 aa  77.4  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  23.16 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0574  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  21.49 
 
 		 462 aa  76.3  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2298  outer membrane efflux protein  21.45 
 
 		 525 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1698  outer membrane efflux protein  21.94 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572085  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  18.44 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  22.08 
 
 		 972 aa  74.3  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  21.6 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 		 578 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 		 578 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  21.49 
 
 		 501 aa  73.6  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  21.49 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0891  outer membrane efflux protein  26.28 
 
 		 508 aa  73.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 		 627 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  18.56 
 
 		 473 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  20.81 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  20.82 
 
 		 635 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  20.91 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1839  outer membrane efflux protein  21.51 
 
 		 466 aa  72  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0879  Outer membrane efflux protein  21.48 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.175744  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0617  outer membrane efflux protein  23.87 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  19.02 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  20.46 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  22.37 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  19.29 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1131  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  21.63 
 
 		 482 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  18.96 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>