More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1629 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 438 aa  886    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0620  outer membrane efflux protein  37.17 
 
 		 435 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000193694  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1145  outer membrane efflux protein  41.09 
 
 		 439 aa  287  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127734  normal  0.206163 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0768  outer membrane efflux protein  40.55 
 
 		 423 aa  280  4e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.151036  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1946  outer membrane efflux protein  38.77 
 
 		 431 aa  269  7e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0494  FusA/NodT family protein  38.57 
 
 		 426 aa  266  7e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.690015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0335  FusA/NodT family protein  38.05 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.73563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  28.95 
 
 		 419 aa  123  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  28.8 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  26.03 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  28.15 
 
 		 446 aa  94.4  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.77 
 
 		 452 aa  94  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.22 
 
 		 457 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.87 
 
 		 455 aa  90.5  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  26.21 
 
 		 472 aa  88.2  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.79 
 
 		 452 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.64 
 
 		 457 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.64 
 
 		 456 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  26.43 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.74 
 
 		 452 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.74 
 
 		 452 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.49 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.46 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  26.32 
 
 		 476 aa  80.5  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  26.32 
 
 		 476 aa  80.5  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  25.07 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  27.39 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  24.79 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1058  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.99 
 
 		 511 aa  73.6  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.712242  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0921  outer membrane efflux protein  27.93 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.99 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  27.59 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  25.21 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  23.64 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.42 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.32 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  22.84 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.35 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.38 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  21.01 
 
 		 451 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  23.24 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  22.57 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.26 
 
 		 460 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.36 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.36 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 		 635 aa  67.8  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.35 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  25.08 
 
 		 461 aa  67  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.61 
 
 		 450 aa  67  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.43 
 
 		 441 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.34 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1698  outer membrane efflux protein  24.87 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572085  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  22.1 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.69 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.72 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.16 
 
 		 522 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0134  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.59 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.54 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.3 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.78 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.29 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3186  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.89 
 
 		 502 aa  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.78 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1003  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.01 
 
 		 462 aa  63.2  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1634  outer membrane efflux protein  22.96 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.194063  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1407  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.53 
 
 		 451 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.17 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.59 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  25.58 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  21.64 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2887  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.65 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.415153  normal  0.13847 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  22.09 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.1 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0814  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.881482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3318  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.39 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 		 738 aa  61.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.57 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.87 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  26.32 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  24.5 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0010  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.76 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  25.09 
 
 		 446 aa  59.7  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1875  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.39 
 
 		 476 aa  60.1  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.06 
 
 		 468 aa  59.7  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.33 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3120  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.34 
 
 		 467 aa  60.1  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.893346  normal  0.154573 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  21.22 
 
 		 418 aa  59.7  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2906  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.81 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  23.63 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  24.11 
 
 		 528 aa  59.7  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.73 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0168  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  23.97 
 
 		 508 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618806  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1037  RND efflux system, outer membrane protein  23.97 
 
 		 508 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.13 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>