96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1442 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1442  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 431 aa  855    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0985  outer membrane efflux protein  29.93 
 
 		 435 aa  176  9e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.146892  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  22.88 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  20.43 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01590  putative outer membrane protein TolC  21.25 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29548  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  18.55 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  22.16 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0617  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 		 447 aa  56.6  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04010  RND efflux system, outer membrane lipoprotein  19.67 
 
 		 504 aa  56.6  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174506  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0814  outer membrane efflux protein  20.38 
 
 		 455 aa  56.2  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.881482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4278  NodT family outer membrane lipoprotein  18.09 
 
 		 483 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  21.86 
 
 		 451 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  20.64 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3737  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.315415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.04 
 
 		 470 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  20.63 
 
 		 472 aa  54.3  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 		 461 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  21.37 
 
 		 449 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  21.08 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  24.21 
 
 		 469 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.96 
 
 		 470 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  21.33 
 
 		 972 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  20.92 
 
 		 500 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2582  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  20.15 
 
 		 474 aa  51.2  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.878784 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  20.74 
 
 		 454 aa  50.8  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  20.69 
 
 		 501 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  20.23 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0943  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  18.05 
 
 		 484 aa  49.7  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  18.45 
 
 		 420 aa  49.7  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13520  putative outer membrane protein  19.94 
 
 		 496 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.620918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1211  hypothetical protein  20.25 
 
 		 496 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1582  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20 
 
 		 515 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  24.3 
 
 		 463 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5135  outer membrane efflux protein  22.04 
 
 		 448 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1258  putative flagellar hook-associated protein 2  21.53 
 
 		 448 aa  48.9  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  23.15 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.74 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  20.06 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  21.1 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0117  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  22.6 
 
 		 482 aa  48.5  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4998  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.03 
 
 		 515 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599541  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4333  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  20.77 
 
 		 499 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00474819  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0888  ComEC/Rec2 family protein  25.62 
 
 		 559 aa  47.8  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1045  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  19.94 
 
 		 494 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.44263 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4486  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21.58 
 
 		 512 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 471 aa  47.4  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20.58 
 
 		 503 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.87 
 
 		 472 aa  47.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  20.26 
 
 		 503 aa  47  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  24.07 
 
 		 463 aa  47  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  19.33 
 
 		 474 aa  47  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2305  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.92 
 
 		 517 aa  46.6  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155955 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.73 
 
 		 475 aa  46.6  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2314  outer membrane efflux protein  18.82 
 
 		 653 aa  46.6  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.682449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02376  putative outer membrane channel lipoprotein transmembrane  19.14 
 
 		 485 aa  46.6  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.0665572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0761  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  20.38 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2690  type I secretion outer membrane protein, putative  18.82 
 
 		 598 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  26.98 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  21.05 
 
 		 1496 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0979  outer membrane efflux protein  20 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  19.57 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2864  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  18.37 
 
 		 468 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0383351  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  21.65 
 
 		 448 aa  46.6  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  22.05 
 
 		 635 aa  45.8  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  18.95 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  21.39 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1275  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.5 
 
 		 590 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0766  RND efflux system outer membrane lipoprotein  19.59 
 
 		 480 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000618276  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2428  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20.91 
 
 		 509 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.440095 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0938  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  19.14 
 
 		 499 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  23.72 
 
 		 482 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2202  putative outer membrane protein  21.08 
 
 		 636 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631683  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2064  outer membrane efflux protein  21.08 
 
 		 581 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0967  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21.15 
 
 		 525 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 495 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.15 
 
 		 505 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1449  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.15 
 
 		 505 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436796  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 446 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1188  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 		 72 aa  44.3  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  19.7 
 
 		 471 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1217  outer membrane efflux protein  19.64 
 
 		 498 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.538027  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 439 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  26.17 
 
 		 438 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  19.57 
 
 		 529 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0929292  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2781  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  19.43 
 
 		 604 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1834  multidrug efflux outer membrane protein EefC  21.08 
 
 		 457 aa  43.9  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000044393 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4865  RND cation/multidrug efflux system outer membrane protein, NodT  19.85 
 
 		 493 aa  43.9  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000716421  normal  0.820676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40250  putative outer membrane protein precursor  19.32 
 
 		 425 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 471 aa  43.5  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 477 aa  43.5  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20.95 
 
 		 483 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  18.7 
 
 		 455 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.16 
 
 		 428 aa  43.1  0.009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  20.8 
 
 		 569 aa  43.1  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0685  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.16 
 
 		 405 aa  43.1  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>