25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0985 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0985  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 435 aa  880    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.146892  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1442  outer membrane efflux protein  29.93 
 
 		 431 aa  176  9e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.63 
 
 		 456 aa  54.7  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.33 
 
 		 452 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.61 
 
 		 482 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  23.87 
 
 		 470 aa  46.6  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  27.86 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  27.86 
 
 		 465 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.62 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  27.86 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.61 
 
 		 471 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.61 
 
 		 482 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.61 
 
 		 482 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  23.11 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.61 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.61 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.61 
 
 		 479 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.61 
 
 		 471 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  29.91 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2560  outer membrane efflux protein  22.47 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1131  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 		 364 aa  44.7  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.86 
 
 		 442 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  27.51 
 
 		 456 aa  43.9  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0688  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  24.89 
 
 		 421 aa  43.5  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.207036  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.4 
 
 		 493 aa  43.5  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>